Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLUHP3Q96NS8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLUHP3Q96NS8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLUHP3Q96NS8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLUHP3Q96NS8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLUHP3Q96NS8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLUHP3Q96NS8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLUHP3Q96NS8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLUHP3Q96NS8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLUHP3Q96NS8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLUHP3Q96NS8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLUHP3Q96NS8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLUHP3Q96NS8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUHP3Q96NS8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUHP3Q96NS8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLUHP3Q96NS8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLUHP3Q96NS8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLUHP3Q96NS8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLUHP3Q96NS8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLUHP3Q96NS8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUHP3Q96NS8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUHP3Q96NS8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLUHP3Q96NS8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUHP3Q96NS8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLUHP3Q96NS8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLUHP3Q96NS8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLUHP3Q96NS8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLUHP3Q96NS8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLUHP3Q96NS8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLUHP3Q96NS8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLUHP3Q96NS8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLUHP3Q96NS8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLUHP3Q96NS8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLUHP3Q96NS8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLUHP3Q96NS8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLUHP3Q96NS8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLUHP3Q96NS8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLUHP3Q96NS8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLUHP3Q96NS8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUHP3Q96NS8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLUHP3Q96NS8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUHP3Q96NS8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUHP3Q96NS8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUHP3Q96NS8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUHP3Q96NS8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUHP3Q96NS8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLUHP3Q96NS8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLUHP3Q96NS8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLUHP3Q96NS8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms