Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IMP4Q96G21 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IMP4Q96G21 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IMP4Q96G21 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IMP4Q96G21 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IMP4Q96G21 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IMP4Q96G21 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IMP4Q96G21 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IMP4Q96G21 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IMP4Q96G21 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IMP4Q96G21 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IMP4Q96G21 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IMP4Q96G21 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IMP4Q96G21 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IMP4Q96G21 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IMP4Q96G21 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IMP4Q96G21 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IMP4Q96G21 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IMP4Q96G21 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IMP4Q96G21 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IMP4Q96G21 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IMP4Q96G21 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IMP4Q96G21 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IMP4Q96G21 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IMP4Q96G21 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IMP4Q96G21 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IMP4Q96G21 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IMP4Q96G21 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IMP4Q96G21 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IMP4Q96G21 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IMP4Q96G21 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
IMP4Q96G21 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IMP4Q96G21 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IMP4Q96G21 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IMP4Q96G21 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IMP4Q96G21 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IMP4Q96G21 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IMP4Q96G21 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IMP4Q96G21 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IMP4Q96G21 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IMP4Q96G21 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IMP4Q96G21 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IMP4Q96G21 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IMP4Q96G21 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IMP4Q96G21 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IMP4Q96G21 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IMP4Q96G21 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IMP4Q96G21 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IMP4Q96G21 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IMP4Q96G21 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IMP4Q96G21 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IMP4Q96G21 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IMP4Q96G21 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IMP4Q96G21 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IMP4Q96G21 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IMP4Q96G21 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IMP4Q96G21 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IMP4Q96G21 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IMP4Q96G21 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IMP4Q96G21 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IMP4Q96G21 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IMP4Q96G21 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IMP4Q96G21 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IMP4Q96G21 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IMP4Q96G21 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IMP4Q96G21 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IMP4Q96G21 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IMP4Q96G21 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IMP4Q96G21 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IMP4Q96G21 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
IMP4Q96G21 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IMP4Q96G21 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IMP4Q96G21 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IMP4Q96G21 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IMP4Q96G21 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IMP4Q96G21 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IMP4Q96G21 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IMP4Q96G21 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IMP4Q96G21 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IMP4Q96G21 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IMP4Q96G21 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
IMP4Q96G21 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IMP4Q96G21 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IMP4Q96G21 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IMP4Q96G21 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IMP4Q96G21 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms