Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF4BQ92750 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF4BQ92750 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF4BQ92750 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF4BQ92750 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TAF4BQ92750 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TAF4BQ92750 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TAF4BQ92750 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAF4BQ92750 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAF4BQ92750 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAF4BQ92750 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAF4BQ92750 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TAF4BQ92750 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TAF4BQ92750 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TAF4BQ92750 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TAF4BQ92750 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TAF4BQ92750 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TAF4BQ92750 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TAF4BQ92750 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TAF4BQ92750 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TAF4BQ92750 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TAF4BQ92750 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TAF4BQ92750 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TAF4BQ92750 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TAF4BQ92750 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF4BQ92750 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF4BQ92750 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF4BQ92750 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TAF4BQ92750 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TAF4BQ92750 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TAF4BQ92750 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TAF4BQ92750 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF4BQ92750 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TAF4BQ92750 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TAF4BQ92750 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TAF4BQ92750 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TAF4BQ92750 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TAF4BQ92750 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TAF4BQ92750 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TAF4BQ92750 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TAF4BQ92750 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TAF4BQ92750 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TAF4BQ92750 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF4BQ92750 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TAF4BQ92750 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TAF4BQ92750 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TAF4BQ92750 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TAF4BQ92750 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAF4BQ92750 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TAF4BQ92750 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TAF4BQ92750 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TAF4BQ92750 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TAF4BQ92750 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF4BQ92750 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF4BQ92750 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF4BQ92750 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF4BQ92750 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF4BQ92750 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF4BQ92750 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF4BQ92750 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF4BQ92750 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF4BQ92750 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TAF4BQ92750 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TAF4BQ92750 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF4BQ92750 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF4BQ92750 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TAF4BQ92750 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TAF4BQ92750 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TAF4BQ92750 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF4BQ92750 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAF4BQ92750 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAF4BQ92750 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAF4BQ92750 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF4BQ92750 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF4BQ92750 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF4BQ92750 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF4BQ92750 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF4BQ92750 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TAF4BQ92750 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TAF4BQ92750 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TAF4BQ92750 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF4BQ92750 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF4BQ92750 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF4BQ92750 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF4BQ92750 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF4BQ92750 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF4BQ92750 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF4BQ92750 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TAF4BQ92750 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF4BQ92750 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF4BQ92750 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF4BQ92750 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF4BQ92750 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF4BQ92750 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF4BQ92750 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF4BQ92750 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF4BQ92750 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TAF4BQ92750 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF4BQ92750 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF4BQ92750 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms