Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHLHE23Q8NDY6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHLHE23Q8NDY6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHLHE23Q8NDY6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHE23Q8NDY6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHE23Q8NDY6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHE23Q8NDY6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHLHE23Q8NDY6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHLHE23Q8NDY6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHLHE23Q8NDY6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHE23Q8NDY6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHLHE23Q8NDY6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHE23Q8NDY6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHE23Q8NDY6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHE23Q8NDY6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHE23Q8NDY6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHE23Q8NDY6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHLHE23Q8NDY6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BHLHE23Q8NDY6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHE23Q8NDY6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHE23Q8NDY6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHE23Q8NDY6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHE23Q8NDY6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHE23Q8NDY6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHE23Q8NDY6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHE23Q8NDY6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHE23Q8NDY6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BHLHE23Q8NDY6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BHLHE23Q8NDY6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHLHE23Q8NDY6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHLHE23Q8NDY6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHLHE23Q8NDY6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHLHE23Q8NDY6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHLHE23Q8NDY6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHE23Q8NDY6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHLHE23Q8NDY6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHLHE23Q8NDY6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHE23Q8NDY6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHE23Q8NDY6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHLHE23Q8NDY6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHLHE23Q8NDY6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHE23Q8NDY6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHE23Q8NDY6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHE23Q8NDY6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHLHE23Q8NDY6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHLHE23Q8NDY6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHE23Q8NDY6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHE23Q8NDY6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHE23Q8NDY6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHLHE23Q8NDY6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHE23Q8NDY6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHE23Q8NDY6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHE23Q8NDY6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHE23Q8NDY6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHE23Q8NDY6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHE23Q8NDY6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE23Q8NDY6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE23Q8NDY6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE23Q8NDY6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE23Q8NDY6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHLHE23Q8NDY6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHLHE23Q8NDY6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHLHE23Q8NDY6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHE23Q8NDY6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE23Q8NDY6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE23Q8NDY6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE23Q8NDY6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE23Q8NDY6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE23Q8NDY6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE23Q8NDY6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHLHE23Q8NDY6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHLHE23Q8NDY6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHLHE23Q8NDY6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BHLHE23Q8NDY6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE23Q8NDY6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE23Q8NDY6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE23Q8NDY6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHE23Q8NDY6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHE23Q8NDY6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHE23Q8NDY6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHE23Q8NDY6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHE23Q8NDY6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHE23Q8NDY6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHE23Q8NDY6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHE23Q8NDY6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms