Protein–RNA interactions for Protein: Q8N370

SLC43A2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A2Q8N370 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC43A2Q8N370 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC43A2Q8N370 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC43A2Q8N370 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC43A2Q8N370 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC43A2Q8N370 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC43A2Q8N370 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC43A2Q8N370 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC43A2Q8N370 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC43A2Q8N370 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC43A2Q8N370 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC43A2Q8N370 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC43A2Q8N370 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC43A2Q8N370 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC43A2Q8N370 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC43A2Q8N370 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC43A2Q8N370 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC43A2Q8N370 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC43A2Q8N370 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC43A2Q8N370 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC43A2Q8N370 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC43A2Q8N370 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC43A2Q8N370 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC43A2Q8N370 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC43A2Q8N370 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC43A2Q8N370 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC43A2Q8N370 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC43A2Q8N370 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC43A2Q8N370 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC43A2Q8N370 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC43A2Q8N370 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC43A2Q8N370 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC43A2Q8N370 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC43A2Q8N370 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC43A2Q8N370 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC43A2Q8N370 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC43A2Q8N370 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC43A2Q8N370 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC43A2Q8N370 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC43A2Q8N370 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC43A2Q8N370 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC43A2Q8N370 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC43A2Q8N370 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC43A2Q8N370 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC43A2Q8N370 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC43A2Q8N370 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC43A2Q8N370 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC43A2Q8N370 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC43A2Q8N370 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC43A2Q8N370 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC43A2Q8N370 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC43A2Q8N370 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC43A2Q8N370 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC43A2Q8N370 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC43A2Q8N370 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC43A2Q8N370 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC43A2Q8N370 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC43A2Q8N370 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC43A2Q8N370 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC43A2Q8N370 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC43A2Q8N370 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC43A2Q8N370 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC43A2Q8N370 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC43A2Q8N370 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC43A2Q8N370 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC43A2Q8N370 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC43A2Q8N370 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC43A2Q8N370 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC43A2Q8N370 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC43A2Q8N370 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC43A2Q8N370 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC43A2Q8N370 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC43A2Q8N370 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC43A2Q8N370 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC43A2Q8N370 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC43A2Q8N370 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC43A2Q8N370 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC43A2Q8N370 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC43A2Q8N370 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC43A2Q8N370 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC43A2Q8N370 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC43A2Q8N370 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC43A2Q8N370 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC43A2Q8N370 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC43A2Q8N370 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms