Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PASD1Q8IV76 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PASD1Q8IV76 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PASD1Q8IV76 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PASD1Q8IV76 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PASD1Q8IV76 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PASD1Q8IV76 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PASD1Q8IV76 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PASD1Q8IV76 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PASD1Q8IV76 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PASD1Q8IV76 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PASD1Q8IV76 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PASD1Q8IV76 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PASD1Q8IV76 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PASD1Q8IV76 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PASD1Q8IV76 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PASD1Q8IV76 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PASD1Q8IV76 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PASD1Q8IV76 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PASD1Q8IV76 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PASD1Q8IV76 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PASD1Q8IV76 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PASD1Q8IV76 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PASD1Q8IV76 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PASD1Q8IV76 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PASD1Q8IV76 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PASD1Q8IV76 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PASD1Q8IV76 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PASD1Q8IV76 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PASD1Q8IV76 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PASD1Q8IV76 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PASD1Q8IV76 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PASD1Q8IV76 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PASD1Q8IV76 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PASD1Q8IV76 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PASD1Q8IV76 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PASD1Q8IV76 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PASD1Q8IV76 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PASD1Q8IV76 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PASD1Q8IV76 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PASD1Q8IV76 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PASD1Q8IV76 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PASD1Q8IV76 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PASD1Q8IV76 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PASD1Q8IV76 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PASD1Q8IV76 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PASD1Q8IV76 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PASD1Q8IV76 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PASD1Q8IV76 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PASD1Q8IV76 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PASD1Q8IV76 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PASD1Q8IV76 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PASD1Q8IV76 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PASD1Q8IV76 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PASD1Q8IV76 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PASD1Q8IV76 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PASD1Q8IV76 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PASD1Q8IV76 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PASD1Q8IV76 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PASD1Q8IV76 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PASD1Q8IV76 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PASD1Q8IV76 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PASD1Q8IV76 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PASD1Q8IV76 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PASD1Q8IV76 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PASD1Q8IV76 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PASD1Q8IV76 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PASD1Q8IV76 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PASD1Q8IV76 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PASD1Q8IV76 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PASD1Q8IV76 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PASD1Q8IV76 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PASD1Q8IV76 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PASD1Q8IV76 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PASD1Q8IV76 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PASD1Q8IV76 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PASD1Q8IV76 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PASD1Q8IV76 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PASD1Q8IV76 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PASD1Q8IV76 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PASD1Q8IV76 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PASD1Q8IV76 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PASD1Q8IV76 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PASD1Q8IV76 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms