Protein–RNA interactions for Protein: Q6X9E4

FBXW12, F-box/WD repeat-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW12Q6X9E4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXW12Q6X9E4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXW12Q6X9E4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXW12Q6X9E4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXW12Q6X9E4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXW12Q6X9E4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXW12Q6X9E4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXW12Q6X9E4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXW12Q6X9E4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXW12Q6X9E4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXW12Q6X9E4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXW12Q6X9E4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXW12Q6X9E4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXW12Q6X9E4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXW12Q6X9E4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXW12Q6X9E4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXW12Q6X9E4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FBXW12Q6X9E4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXW12Q6X9E4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXW12Q6X9E4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXW12Q6X9E4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXW12Q6X9E4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXW12Q6X9E4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXW12Q6X9E4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXW12Q6X9E4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXW12Q6X9E4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW12Q6X9E4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXW12Q6X9E4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXW12Q6X9E4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXW12Q6X9E4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXW12Q6X9E4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXW12Q6X9E4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXW12Q6X9E4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms