Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HERC4Q5GLZ8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HERC4Q5GLZ8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HERC4Q5GLZ8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HERC4Q5GLZ8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HERC4Q5GLZ8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HERC4Q5GLZ8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HERC4Q5GLZ8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HERC4Q5GLZ8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HERC4Q5GLZ8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HERC4Q5GLZ8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HERC4Q5GLZ8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HERC4Q5GLZ8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HERC4Q5GLZ8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HERC4Q5GLZ8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HERC4Q5GLZ8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HERC4Q5GLZ8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HERC4Q5GLZ8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HERC4Q5GLZ8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HERC4Q5GLZ8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
HERC4Q5GLZ8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HERC4Q5GLZ8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HERC4Q5GLZ8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HERC4Q5GLZ8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HERC4Q5GLZ8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HERC4Q5GLZ8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HERC4Q5GLZ8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HERC4Q5GLZ8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
HERC4Q5GLZ8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
HERC4Q5GLZ8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HERC4Q5GLZ8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HERC4Q5GLZ8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HERC4Q5GLZ8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HERC4Q5GLZ8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HERC4Q5GLZ8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
HERC4Q5GLZ8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
HERC4Q5GLZ8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HERC4Q5GLZ8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HERC4Q5GLZ8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HERC4Q5GLZ8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HERC4Q5GLZ8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HERC4Q5GLZ8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HERC4Q5GLZ8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HERC4Q5GLZ8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HERC4Q5GLZ8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HERC4Q5GLZ8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HERC4Q5GLZ8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HERC4Q5GLZ8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HERC4Q5GLZ8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HERC4Q5GLZ8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HERC4Q5GLZ8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HERC4Q5GLZ8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
HERC4Q5GLZ8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HERC4Q5GLZ8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HERC4Q5GLZ8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HERC4Q5GLZ8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HERC4Q5GLZ8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HERC4Q5GLZ8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HERC4Q5GLZ8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HERC4Q5GLZ8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HERC4Q5GLZ8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HERC4Q5GLZ8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
HERC4Q5GLZ8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HERC4Q5GLZ8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HERC4Q5GLZ8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HERC4Q5GLZ8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HERC4Q5GLZ8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HERC4Q5GLZ8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HERC4Q5GLZ8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HERC4Q5GLZ8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HERC4Q5GLZ8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HERC4Q5GLZ8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms