Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSLNQ13421 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSLNQ13421 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSLNQ13421 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSLNQ13421 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSLNQ13421 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSLNQ13421 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSLNQ13421 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSLNQ13421 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSLNQ13421 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSLNQ13421 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSLNQ13421 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSLNQ13421 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSLNQ13421 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSLNQ13421 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSLNQ13421 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSLNQ13421 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSLNQ13421 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MSLNQ13421 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MSLNQ13421 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MSLNQ13421 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSLNQ13421 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSLNQ13421 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSLNQ13421 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSLNQ13421 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MSLNQ13421 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSLNQ13421 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSLNQ13421 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSLNQ13421 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSLNQ13421 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSLNQ13421 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSLNQ13421 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSLNQ13421 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSLNQ13421 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSLNQ13421 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSLNQ13421 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSLNQ13421 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSLNQ13421 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MSLNQ13421 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MSLNQ13421 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MSLNQ13421 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MSLNQ13421 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MSLNQ13421 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSLNQ13421 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSLNQ13421 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MSLNQ13421 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSLNQ13421 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSLNQ13421 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSLNQ13421 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSLNQ13421 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSLNQ13421 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSLNQ13421 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MSLNQ13421 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSLNQ13421 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSLNQ13421 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSLNQ13421 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MSLNQ13421 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MSLNQ13421 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSLNQ13421 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSLNQ13421 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSLNQ13421 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSLNQ13421 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSLNQ13421 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSLNQ13421 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSLNQ13421 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MSLNQ13421 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MSLNQ13421 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MSLNQ13421 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSLNQ13421 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSLNQ13421 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSLNQ13421 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSLNQ13421 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSLNQ13421 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSLNQ13421 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSLNQ13421 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSLNQ13421 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MSLNQ13421 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MSLNQ13421 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSLNQ13421 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSLNQ13421 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSLNQ13421 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSLNQ13421 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSLNQ13421 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSLNQ13421 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSLNQ13421 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSLNQ13421 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
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