Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECH1Q13011 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECH1Q13011 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECH1Q13011 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECH1Q13011 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECH1Q13011 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECH1Q13011 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECH1Q13011 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECH1Q13011 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECH1Q13011 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECH1Q13011 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECH1Q13011 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECH1Q13011 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECH1Q13011 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECH1Q13011 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECH1Q13011 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECH1Q13011 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECH1Q13011 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECH1Q13011 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ECH1Q13011 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECH1Q13011 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECH1Q13011 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ECH1Q13011 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ECH1Q13011 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ECH1Q13011 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECH1Q13011 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECH1Q13011 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECH1Q13011 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECH1Q13011 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECH1Q13011 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECH1Q13011 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECH1Q13011 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECH1Q13011 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECH1Q13011 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECH1Q13011 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECH1Q13011 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECH1Q13011 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECH1Q13011 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECH1Q13011 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ECH1Q13011 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECH1Q13011 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECH1Q13011 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECH1Q13011 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECH1Q13011 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECH1Q13011 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECH1Q13011 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECH1Q13011 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECH1Q13011 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECH1Q13011 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECH1Q13011 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECH1Q13011 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECH1Q13011 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECH1Q13011 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECH1Q13011 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECH1Q13011 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECH1Q13011 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECH1Q13011 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECH1Q13011 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECH1Q13011 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECH1Q13011 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECH1Q13011 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECH1Q13011 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECH1Q13011 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECH1Q13011 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECH1Q13011 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECH1Q13011 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ECH1Q13011 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ECH1Q13011 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ECH1Q13011 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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