Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ECH1Q13011 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ECH1Q13011 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ECH1Q13011 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECH1Q13011 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ECH1Q13011 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ECH1Q13011 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ECH1Q13011 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECH1Q13011 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ECH1Q13011 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ECH1Q13011 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ECH1Q13011 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECH1Q13011 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECH1Q13011 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECH1Q13011 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECH1Q13011 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECH1Q13011 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECH1Q13011 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECH1Q13011 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECH1Q13011 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECH1Q13011 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECH1Q13011 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECH1Q13011 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECH1Q13011 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECH1Q13011 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECH1Q13011 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECH1Q13011 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECH1Q13011 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECH1Q13011 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECH1Q13011 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECH1Q13011 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECH1Q13011 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECH1Q13011 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECH1Q13011 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ECH1Q13011 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECH1Q13011 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECH1Q13011 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECH1Q13011 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECH1Q13011 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECH1Q13011 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECH1Q13011 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECH1Q13011 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECH1Q13011 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ECH1Q13011 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ECH1Q13011 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECH1Q13011 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECH1Q13011 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECH1Q13011 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECH1Q13011 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECH1Q13011 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECH1Q13011 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ECH1Q13011 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ECH1Q13011 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ECH1Q13011 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECH1Q13011 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ECH1Q13011 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ECH1Q13011 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECH1Q13011 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECH1Q13011 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECH1Q13011 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECH1Q13011 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECH1Q13011 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECH1Q13011 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECH1Q13011 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECH1Q13011 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECH1Q13011 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECH1Q13011 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECH1Q13011 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECH1Q13011 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECH1Q13011 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECH1Q13011 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ECH1Q13011 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECH1Q13011 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECH1Q13011 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECH1Q13011 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECH1Q13011 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECH1Q13011 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECH1Q13011 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECH1Q13011 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECH1Q13011 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECH1Q13011 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECH1Q13011 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECH1Q13011 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECH1Q13011 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECH1Q13011 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECH1Q13011 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECH1Q13011 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ECH1Q13011 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECH1Q13011 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECH1Q13011 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECH1Q13011 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECH1Q13011 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECH1Q13011 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECH1Q13011 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECH1Q13011 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECH1Q13011 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECH1Q13011 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECH1Q13011 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECH1Q13011 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECH1Q13011 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
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