Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUDPQ08623 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PUDPQ08623 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUDPQ08623 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUDPQ08623 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUDPQ08623 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUDPQ08623 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUDPQ08623 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUDPQ08623 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUDPQ08623 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUDPQ08623 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUDPQ08623 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUDPQ08623 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUDPQ08623 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PUDPQ08623 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PUDPQ08623 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUDPQ08623 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PUDPQ08623 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUDPQ08623 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUDPQ08623 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUDPQ08623 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUDPQ08623 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUDPQ08623 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUDPQ08623 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUDPQ08623 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUDPQ08623 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUDPQ08623 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUDPQ08623 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUDPQ08623 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUDPQ08623 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUDPQ08623 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUDPQ08623 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUDPQ08623 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUDPQ08623 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUDPQ08623 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUDPQ08623 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUDPQ08623 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUDPQ08623 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUDPQ08623 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUDPQ08623 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUDPQ08623 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUDPQ08623 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUDPQ08623 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PUDPQ08623 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUDPQ08623 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUDPQ08623 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUDPQ08623 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUDPQ08623 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUDPQ08623 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUDPQ08623 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUDPQ08623 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUDPQ08623 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUDPQ08623 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUDPQ08623 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUDPQ08623 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUDPQ08623 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUDPQ08623 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUDPQ08623 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUDPQ08623 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUDPQ08623 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUDPQ08623 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUDPQ08623 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUDPQ08623 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUDPQ08623 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUDPQ08623 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUDPQ08623 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUDPQ08623 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUDPQ08623 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUDPQ08623 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUDPQ08623 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUDPQ08623 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUDPQ08623 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUDPQ08623 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUDPQ08623 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUDPQ08623 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUDPQ08623 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUDPQ08623 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUDPQ08623 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUDPQ08623 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUDPQ08623 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUDPQ08623 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms