Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GSCP56915 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GSCP56915 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GSCP56915 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GSCP56915 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GSCP56915 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GSCP56915 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GSCP56915 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSCP56915 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSCP56915 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSCP56915 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GSCP56915 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GSCP56915 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GSCP56915 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSCP56915 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GSCP56915 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GSCP56915 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GSCP56915 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GSCP56915 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GSCP56915 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSCP56915 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSCP56915 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GSCP56915 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GSCP56915 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GSCP56915 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GSCP56915 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GSCP56915 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GSCP56915 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GSCP56915 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GSCP56915 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GSCP56915 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GSCP56915 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSCP56915 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSCP56915 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GSCP56915 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GSCP56915 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GSCP56915 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GSCP56915 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GSCP56915 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GSCP56915 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GSCP56915 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GSCP56915 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GSCP56915 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GSCP56915 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GSCP56915 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GSCP56915 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GSCP56915 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GSCP56915 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GSCP56915 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GSCP56915 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GSCP56915 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GSCP56915 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GSCP56915 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GSCP56915 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GSCP56915 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GSCP56915 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GSCP56915 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GSCP56915 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GSCP56915 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GSCP56915 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GSCP56915 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GSCP56915 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GSCP56915 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GSCP56915 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GSCP56915 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GSCP56915 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GSCP56915 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GSCP56915 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GSCP56915 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GSCP56915 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GSCP56915 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GSCP56915 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GSCP56915 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GSCP56915 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GSCP56915 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GSCP56915 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GSCP56915 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GSCP56915 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GSCP56915 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GSCP56915 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GSCP56915 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GSCP56915 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GSCP56915 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GSCP56915 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GSCP56915 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GSCP56915 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GSCP56915 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GSCP56915 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GSCP56915 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GSCP56915 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GSCP56915 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GSCP56915 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GSCP56915 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GSCP56915 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GSCP56915 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GSCP56915 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GSCP56915 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GSCP56915 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GSCP56915 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GSCP56915 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms