Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HNMTP50135 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HNMTP50135 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HNMTP50135 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HNMTP50135 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HNMTP50135 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HNMTP50135 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HNMTP50135 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HNMTP50135 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HNMTP50135 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HNMTP50135 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HNMTP50135 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HNMTP50135 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HNMTP50135 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HNMTP50135 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HNMTP50135 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HNMTP50135 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HNMTP50135 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HNMTP50135 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HNMTP50135 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HNMTP50135 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HNMTP50135 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HNMTP50135 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HNMTP50135 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HNMTP50135 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HNMTP50135 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HNMTP50135 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HNMTP50135 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HNMTP50135 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HNMTP50135 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HNMTP50135 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HNMTP50135 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HNMTP50135 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HNMTP50135 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HNMTP50135 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HNMTP50135 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HNMTP50135 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HNMTP50135 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HNMTP50135 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HNMTP50135 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HNMTP50135 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HNMTP50135 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HNMTP50135 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HNMTP50135 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HNMTP50135 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HNMTP50135 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HNMTP50135 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HNMTP50135 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HNMTP50135 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HNMTP50135 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HNMTP50135 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HNMTP50135 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HNMTP50135 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HNMTP50135 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HNMTP50135 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HNMTP50135 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HNMTP50135 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HNMTP50135 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HNMTP50135 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HNMTP50135 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HNMTP50135 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HNMTP50135 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HNMTP50135 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HNMTP50135 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HNMTP50135 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HNMTP50135 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HNMTP50135 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HNMTP50135 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HNMTP50135 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HNMTP50135 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HNMTP50135 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HNMTP50135 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HNMTP50135 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HNMTP50135 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HNMTP50135 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HNMTP50135 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HNMTP50135 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HNMTP50135 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HNMTP50135 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HNMTP50135 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HNMTP50135 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HNMTP50135 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HNMTP50135 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HNMTP50135 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HNMTP50135 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HNMTP50135 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HNMTP50135 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HNMTP50135 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HNMTP50135 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HNMTP50135 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HNMTP50135 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HNMTP50135 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HNMTP50135 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HNMTP50135 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HNMTP50135 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HNMTP50135 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HNMTP50135 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HNMTP50135 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HNMTP50135 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HNMTP50135 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.5 ms