Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RGS4P49798 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGS4P49798 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGS4P49798 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGS4P49798 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGS4P49798 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGS4P49798 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGS4P49798 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGS4P49798 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGS4P49798 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGS4P49798 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGS4P49798 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGS4P49798 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGS4P49798 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGS4P49798 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGS4P49798 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGS4P49798 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGS4P49798 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGS4P49798 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGS4P49798 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGS4P49798 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGS4P49798 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGS4P49798 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGS4P49798 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGS4P49798 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGS4P49798 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGS4P49798 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGS4P49798 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGS4P49798 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGS4P49798 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGS4P49798 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGS4P49798 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGS4P49798 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGS4P49798 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGS4P49798 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGS4P49798 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGS4P49798 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGS4P49798 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGS4P49798 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGS4P49798 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGS4P49798 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGS4P49798 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGS4P49798 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGS4P49798 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGS4P49798 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGS4P49798 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGS4P49798 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RGS4P49798 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGS4P49798 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGS4P49798 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGS4P49798 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGS4P49798 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGS4P49798 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGS4P49798 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGS4P49798 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGS4P49798 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGS4P49798 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGS4P49798 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGS4P49798 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGS4P49798 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RGS4P49798 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGS4P49798 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGS4P49798 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGS4P49798 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGS4P49798 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGS4P49798 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGS4P49798 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGS4P49798 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGS4P49798 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGS4P49798 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGS4P49798 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGS4P49798 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGS4P49798 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGS4P49798 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGS4P49798 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGS4P49798 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGS4P49798 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGS4P49798 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGS4P49798 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGS4P49798 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGS4P49798 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGS4P49798 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGS4P49798 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGS4P49798 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGS4P49798 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGS4P49798 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGS4P49798 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGS4P49798 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGS4P49798 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGS4P49798 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGS4P49798 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGS4P49798 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGS4P49798 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGS4P49798 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGS4P49798 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGS4P49798 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGS4P49798 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGS4P49798 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGS4P49798 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGS4P49798 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms