Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGS4P49798 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RGS4P49798 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
RGS4P49798 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGS4P49798 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RGS4P49798 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGS4P49798 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGS4P49798 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RGS4P49798 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RGS4P49798 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RGS4P49798 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RGS4P49798 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RGS4P49798 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RGS4P49798 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGS4P49798 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RGS4P49798 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RGS4P49798 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RGS4P49798 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RGS4P49798 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RGS4P49798 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGS4P49798 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGS4P49798 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RGS4P49798 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RGS4P49798 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RGS4P49798 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RGS4P49798 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RGS4P49798 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RGS4P49798 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGS4P49798 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGS4P49798 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGS4P49798 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGS4P49798 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGS4P49798 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGS4P49798 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGS4P49798 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGS4P49798 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RGS4P49798 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGS4P49798 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGS4P49798 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGS4P49798 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGS4P49798 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGS4P49798 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGS4P49798 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGS4P49798 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGS4P49798 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGS4P49798 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGS4P49798 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGS4P49798 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RGS4P49798 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RGS4P49798 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RGS4P49798 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGS4P49798 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGS4P49798 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGS4P49798 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGS4P49798 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGS4P49798 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGS4P49798 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGS4P49798 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGS4P49798 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGS4P49798 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGS4P49798 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGS4P49798 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGS4P49798 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGS4P49798 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGS4P49798 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGS4P49798 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGS4P49798 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGS4P49798 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGS4P49798 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RGS4P49798 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGS4P49798 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RGS4P49798 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGS4P49798 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGS4P49798 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGS4P49798 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGS4P49798 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGS4P49798 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGS4P49798 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGS4P49798 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGS4P49798 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGS4P49798 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGS4P49798 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGS4P49798 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGS4P49798 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RGS4P49798 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGS4P49798 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGS4P49798 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGS4P49798 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGS4P49798 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGS4P49798 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGS4P49798 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGS4P49798 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGS4P49798 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGS4P49798 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGS4P49798 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGS4P49798 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RGS4P49798 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGS4P49798 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGS4P49798 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGS4P49798 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms