Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRA2P47869 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRA2P47869 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA2P47869 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA2P47869 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA2P47869 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA2P47869 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA2P47869 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA2P47869 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA2P47869 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA2P47869 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA2P47869 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRA2P47869 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABRA2P47869 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA2P47869 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA2P47869 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA2P47869 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA2P47869 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA2P47869 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA2P47869 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA2P47869 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA2P47869 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA2P47869 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA2P47869 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA2P47869 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA2P47869 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA2P47869 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA2P47869 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA2P47869 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA2P47869 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA2P47869 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA2P47869 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA2P47869 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA2P47869 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA2P47869 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA2P47869 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA2P47869 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA2P47869 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA2P47869 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA2P47869 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA2P47869 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA2P47869 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA2P47869 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA2P47869 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA2P47869 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA2P47869 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA2P47869 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA2P47869 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA2P47869 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA2P47869 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA2P47869 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA2P47869 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA2P47869 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA2P47869 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA2P47869 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRA2P47869 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRA2P47869 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRA2P47869 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA2P47869 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GABRA2P47869 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRA2P47869 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA2P47869 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA2P47869 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA2P47869 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA2P47869 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA2P47869 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA2P47869 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA2P47869 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms