Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABRA2P47869 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABRA2P47869 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GABRA2P47869 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GABRA2P47869 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GABRA2P47869 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABRA2P47869 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GABRA2P47869 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRA2P47869 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABRA2P47869 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABRA2P47869 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABRA2P47869 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRA2P47869 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABRA2P47869 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRA2P47869 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABRA2P47869 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRA2P47869 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRA2P47869 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GABRA2P47869 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABRA2P47869 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABRA2P47869 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRA2P47869 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRA2P47869 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABRA2P47869 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRA2P47869 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRA2P47869 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRA2P47869 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRA2P47869 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRA2P47869 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRA2P47869 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRA2P47869 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRA2P47869 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRA2P47869 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRA2P47869 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRA2P47869 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRA2P47869 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRA2P47869 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRA2P47869 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRA2P47869 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRA2P47869 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRA2P47869 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRA2P47869 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRA2P47869 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRA2P47869 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRA2P47869 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRA2P47869 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRA2P47869 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRA2P47869 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRA2P47869 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRA2P47869 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA2P47869 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRA2P47869 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRA2P47869 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRA2P47869 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRA2P47869 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRA2P47869 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRA2P47869 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRA2P47869 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRA2P47869 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRA2P47869 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRA2P47869 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRA2P47869 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA2P47869 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRA2P47869 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRA2P47869 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRA2P47869 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRA2P47869 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRA2P47869 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRA2P47869 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRA2P47869 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRA2P47869 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRA2P47869 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRA2P47869 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRA2P47869 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRA2P47869 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRA2P47869 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRA2P47869 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRA2P47869 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRA2P47869 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRA2P47869 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRA2P47869 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRA2P47869 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRA2P47869 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRA2P47869 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRA2P47869 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRA2P47869 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRA2P47869 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRA2P47869 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRA2P47869 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA2P47869 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA2P47869 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRA2P47869 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRA2P47869 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRA2P47869 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRA2P47869 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA2P47869 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA2P47869 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA2P47869 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRA2P47869 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRA2P47869 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms