Protein–RNA interactions for Protein: P46098

HTR3A, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3AP46098 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTR3AP46098 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTR3AP46098 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTR3AP46098 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTR3AP46098 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTR3AP46098 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR3AP46098 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR3AP46098 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HTR3AP46098 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTR3AP46098 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTR3AP46098 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTR3AP46098 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTR3AP46098 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTR3AP46098 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTR3AP46098 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR3AP46098 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR3AP46098 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR3AP46098 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR3AP46098 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR3AP46098 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR3AP46098 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR3AP46098 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR3AP46098 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR3AP46098 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR3AP46098 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR3AP46098 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR3AP46098 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR3AP46098 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR3AP46098 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR3AP46098 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR3AP46098 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTR3AP46098 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTR3AP46098 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR3AP46098 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR3AP46098 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR3AP46098 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR3AP46098 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR3AP46098 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR3AP46098 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR3AP46098 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR3AP46098 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTR3AP46098 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR3AP46098 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR3AP46098 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR3AP46098 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTR3AP46098 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR3AP46098 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR3AP46098 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTR3AP46098 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTR3AP46098 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTR3AP46098 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTR3AP46098 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTR3AP46098 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR3AP46098 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR3AP46098 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR3AP46098 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR3AP46098 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR3AP46098 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR3AP46098 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR3AP46098 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR3AP46098 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR3AP46098 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR3AP46098 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR3AP46098 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR3AP46098 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR3AP46098 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR3AP46098 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms