Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HADHAP40939 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HADHAP40939 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HADHAP40939 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HADHAP40939 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HADHAP40939 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HADHAP40939 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HADHAP40939 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HADHAP40939 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HADHAP40939 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HADHAP40939 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HADHAP40939 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HADHAP40939 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HADHAP40939 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HADHAP40939 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HADHAP40939 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HADHAP40939 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HADHAP40939 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HADHAP40939 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HADHAP40939 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HADHAP40939 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HADHAP40939 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HADHAP40939 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HADHAP40939 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HADHAP40939 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HADHAP40939 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HADHAP40939 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HADHAP40939 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HADHAP40939 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HADHAP40939 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HADHAP40939 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HADHAP40939 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HADHAP40939 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HADHAP40939 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HADHAP40939 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HADHAP40939 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HADHAP40939 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HADHAP40939 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HADHAP40939 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HADHAP40939 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HADHAP40939 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HADHAP40939 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HADHAP40939 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HADHAP40939 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HADHAP40939 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HADHAP40939 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HADHAP40939 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HADHAP40939 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HADHAP40939 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HADHAP40939 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HADHAP40939 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HADHAP40939 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HADHAP40939 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HADHAP40939 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HADHAP40939 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HADHAP40939 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HADHAP40939 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HADHAP40939 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HADHAP40939 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HADHAP40939 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HADHAP40939 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HADHAP40939 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HADHAP40939 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HADHAP40939 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HADHAP40939 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HADHAP40939 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HADHAP40939 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HADHAP40939 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HADHAP40939 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HADHAP40939 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HADHAP40939 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HADHAP40939 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HADHAP40939 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HADHAP40939 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HADHAP40939 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HADHAP40939 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HADHAP40939 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HADHAP40939 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HADHAP40939 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HADHAP40939 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HADHAP40939 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HADHAP40939 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HADHAP40939 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HADHAP40939 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HADHAP40939 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HADHAP40939 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HADHAP40939 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HADHAP40939 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HADHAP40939 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HADHAP40939 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HADHAP40939 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HADHAP40939 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HADHAP40939 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HADHAP40939 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HADHAP40939 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HADHAP40939 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HADHAP40939 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HADHAP40939 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HADHAP40939 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HADHAP40939 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms