Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCAP17252 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCAP17252 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCAP17252 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCAP17252 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCAP17252 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCAP17252 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCAP17252 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCAP17252 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCAP17252 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCAP17252 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCAP17252 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCAP17252 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCAP17252 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCAP17252 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCAP17252 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCAP17252 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCAP17252 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCAP17252 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCAP17252 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCAP17252 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCAP17252 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCAP17252 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCAP17252 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCAP17252 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCAP17252 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKCAP17252 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCAP17252 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCAP17252 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCAP17252 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCAP17252 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCAP17252 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCAP17252 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCAP17252 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCAP17252 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCAP17252 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCAP17252 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCAP17252 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCAP17252 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCAP17252 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCAP17252 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCAP17252 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCAP17252 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCAP17252 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCAP17252 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCAP17252 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCAP17252 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCAP17252 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCAP17252 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCAP17252 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCAP17252 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCAP17252 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms