Protein–RNA interactions for Protein: P12956

XRCC6, X-ray repair cross-complementing protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6P12956 MIB2-226ENST00000511502 3326 ntTSL 219.76■□□□□ 0.757e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-210ENST00000479659 4247 ntTSL 219.26■□□□□ 0.677e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-230ENST00000514363 592 ntTSL 319.18■□□□□ 0.667e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-209ENST00000635970 1958 ntTSL 519.02■□□□□ 0.647e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.527e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-206ENST00000523237 835 ntTSL 318.07■□□□□ 0.487e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.47e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 PLEKHA8P1-204ENST00000550498 487 ntTSL 317.19■□□□□ 0.347e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.277e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.097e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-212ENST00000637083 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.067e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-201ENST00000331222 7169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.537e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 PLD1-215ENST00000497307 1506 ntTSL 221.03■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 PLD1-205ENST00000440204 646 ntTSL 414.71□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 PLD1-207ENST00000460926 1012 ntTSL 27.5□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 PLD1-216ENST00000498278 996 ntTSL 56.44□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.523e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.156e-10■■■■■ 46
XRCC6P12956 SF3B1-211ENST00000487698 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.686e-10■■■■■ 46
XRCC6P12956 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.186e-10■■■■■ 46
XRCC6P12956 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.566e-10■■■■■ 46
XRCC6P12956 SF3B1-203ENST00000414174 593 ntTSL 43.85□□□□□ -1.796e-10■■■■■ 46
XRCC6P12956 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.354e-11■■■■■ 45.8
XRCC6P12956 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.284e-11■■■■■ 45.8
XRCC6P12956 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 56.59□□□□□ -1.354e-11■■■■■ 45.8
XRCC6P12956 RSRP1-222ENST00000570063 1821 ntTSL 521.19■□□□□ 0.985e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.615e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-204ENST00000473314 3034 ntTSL 217.75■□□□□ 0.435e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-217ENST00000568254 2013 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.415e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-212ENST00000565733 772 ntTSL 315.83■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-207ENST00000498238 2941 ntTSL 215.57■□□□□ 0.085e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-205ENST00000475766 525 ntTSL 411.77□□□□□ -0.535e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-213ENST00000566395 824 ntTSL 36.89□□□□□ -1.315e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-210ENST00000564223 395 ntTSL 35.77□□□□□ -1.495e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-221ENST00000569495 901 ntTSL 24.84□□□□□ -1.635e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.222e-7■■■■■ 44.3
XRCC6P12956 ATAD3B-203ENST00000472194 4314 ntTSL 1 (best)14.17□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 44.3
XRCC6P12956 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.271e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.541e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.481e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 SH3BP4-205ENST00000444916 570 ntTSL 415.77■□□□□ 0.121e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.11e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG18-236ENST00000438412 2440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.071e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 SH3BP4-206ENST00000446904 829 ntTSL 311.43□□□□□ -0.581e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG18-240ENST00000454269 2430 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.641e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 SH3BP4-208ENST00000462602 257 ntTSL 510.52□□□□□ -0.731e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 SH3BP4-207ENST00000454947 500 ntTSL 410.5□□□□□ -0.731e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.941e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.191e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.271e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.51e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 ACO2-204ENST00000471094 699 ntTSL 325.07■■□□□ 1.63e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 OGFOD3-208ENST00000580445 1274 ntTSL 1 (best)23.76■■□□□ 1.393e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 OGFOD3-203ENST00000577495 872 ntTSL 323.28■■□□□ 1.323e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 OGFOD3-204ENST00000577606 598 ntTSL 422.44■■□□□ 1.183e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 OGFOD3-212ENST00000583897 896 ntTSL 521.08■□□□□ 0.973e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.963e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 ZDHHC8-207ENST00000472497 909 ntTSL 219.5■□□□□ 0.713e-8■■■■■ 44
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XRCC6P12956 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.253e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 44
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XRCC6P12956 YES1-204ENST00000581960 487 ntTSL 326.78■■□□□ 1.882e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 YES1-202ENST00000577611 568 ntTSL 422.05■■□□□ 1.122e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.032e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.982e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -12e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.22e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 GFPT1-203ENST00000493759 524 ntTSL 54.37□□□□□ -1.712e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 ERI3-203ENST00000452396 764 ntTSL 325.22■■□□□ 1.632e-10■■■■■ 43.3
XRCC6P12956 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.522e-10■■■■■ 43.3
XRCC6P12956 ERI3-204ENST00000456170 1103 ntTSL 514.59□□□□□ -0.072e-10■■■■■ 43.3
XRCC6P12956 ERI3-202ENST00000372259 1332 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.612e-10■■■■■ 43.3
XRCC6P12956 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.929e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.299e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-208ENST00000473256 1771 ntTSL 220.29■□□□□ 0.849e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 519.56■□□□□ 0.729e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 519.36■□□□□ 0.699e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.689e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-210ENST00000562482 735 ntTSL 218.04■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.269e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 TKT-204ENST00000450814 1941 ntTSL 220.66■□□□□ 0.91e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-213ENST00000487660 610 ntTSL 218.56■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-210ENST00000469678 1871 ntTSL 518.29■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.511e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-211ENST00000472528 1055 ntTSL 1 (best)17.04■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 43.1
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