Protein–RNA interactions for Protein: P12956

XRCC6, X-ray repair cross-complementing protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6P12956 MIB2-226ENST00000511502 3326 ntTSL 219.76■□□□□ 0.757e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-210ENST00000479659 4247 ntTSL 219.26■□□□□ 0.677e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-230ENST00000514363 592 ntTSL 319.18■□□□□ 0.667e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-209ENST00000635970 1958 ntTSL 519.02■□□□□ 0.647e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.527e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-206ENST00000523237 835 ntTSL 318.07■□□□□ 0.487e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.47e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 PLEKHA8P1-204ENST00000550498 487 ntTSL 317.19■□□□□ 0.347e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.277e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.097e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-212ENST00000637083 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.067e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-201ENST00000331222 7169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.537e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 PLD1-215ENST00000497307 1506 ntTSL 221.03■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 PLD1-205ENST00000440204 646 ntTSL 414.71□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 PLD1-207ENST00000460926 1012 ntTSL 27.5□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 PLD1-216ENST00000498278 996 ntTSL 56.44□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.523e-6■■■■■ 46.1
XRCC6P12956 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.156e-10■■■■■ 46
XRCC6P12956 SF3B1-211ENST00000487698 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.686e-10■■■■■ 46
XRCC6P12956 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.186e-10■■■■■ 46
XRCC6P12956 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.566e-10■■■■■ 46
XRCC6P12956 SF3B1-203ENST00000414174 593 ntTSL 43.85□□□□□ -1.796e-10■■■■■ 46
XRCC6P12956 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.354e-11■■■■■ 45.8
XRCC6P12956 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.284e-11■■■■■ 45.8
XRCC6P12956 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 56.59□□□□□ -1.354e-11■■■■■ 45.8
XRCC6P12956 RSRP1-222ENST00000570063 1821 ntTSL 521.19■□□□□ 0.985e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.615e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-204ENST00000473314 3034 ntTSL 217.75■□□□□ 0.435e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-217ENST00000568254 2013 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.415e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-212ENST00000565733 772 ntTSL 315.83■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-207ENST00000498238 2941 ntTSL 215.57■□□□□ 0.085e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-205ENST00000475766 525 ntTSL 411.77□□□□□ -0.535e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-213ENST00000566395 824 ntTSL 36.89□□□□□ -1.315e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-210ENST00000564223 395 ntTSL 35.77□□□□□ -1.495e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 RSRP1-221ENST00000569495 901 ntTSL 24.84□□□□□ -1.635e-8■■■■■ 44.6
XRCC6P12956 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.222e-7■■■■■ 44.3
XRCC6P12956 ATAD3B-203ENST00000472194 4314 ntTSL 1 (best)14.17□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 44.3
XRCC6P12956 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.271e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.541e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.481e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 SH3BP4-205ENST00000444916 570 ntTSL 415.77■□□□□ 0.121e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.11e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG18-236ENST00000438412 2440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.071e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 SH3BP4-206ENST00000446904 829 ntTSL 311.43□□□□□ -0.581e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG18-240ENST00000454269 2430 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.641e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 SH3BP4-208ENST00000462602 257 ntTSL 510.52□□□□□ -0.731e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 SH3BP4-207ENST00000454947 500 ntTSL 410.5□□□□□ -0.731e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.941e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.191e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.271e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.51e-10■■■■■ 44.1
XRCC6P12956 ACO2-204ENST00000471094 699 ntTSL 325.07■■□□□ 1.63e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 OGFOD3-208ENST00000580445 1274 ntTSL 1 (best)23.76■■□□□ 1.393e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 OGFOD3-203ENST00000577495 872 ntTSL 323.28■■□□□ 1.323e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 OGFOD3-204ENST00000577606 598 ntTSL 422.44■■□□□ 1.183e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 OGFOD3-212ENST00000583897 896 ntTSL 521.08■□□□□ 0.973e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.963e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 ZDHHC8-207ENST00000472497 909 ntTSL 219.5■□□□□ 0.713e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.393e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.333e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.253e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 44
XRCC6P12956 SLCO5A1-204ENST00000526750 2650 ntTSL 528.27■■■□□ 2.122e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 YES1-204ENST00000581960 487 ntTSL 326.78■■□□□ 1.882e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 YES1-202ENST00000577611 568 ntTSL 422.05■■□□□ 1.122e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.032e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.982e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -12e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.22e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 GFPT1-203ENST00000493759 524 ntTSL 54.37□□□□□ -1.712e-9■■■■■ 43.7
XRCC6P12956 ERI3-203ENST00000452396 764 ntTSL 325.22■■□□□ 1.632e-10■■■■■ 43.3
XRCC6P12956 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.522e-10■■■■■ 43.3
XRCC6P12956 ERI3-204ENST00000456170 1103 ntTSL 514.59□□□□□ -0.072e-10■■■■■ 43.3
XRCC6P12956 ERI3-202ENST00000372259 1332 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.612e-10■■■■■ 43.3
XRCC6P12956 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.929e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.299e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-208ENST00000473256 1771 ntTSL 220.29■□□□□ 0.849e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 519.56■□□□□ 0.729e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 519.36■□□□□ 0.699e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.689e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-210ENST00000562482 735 ntTSL 218.04■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.269e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 43.2
XRCC6P12956 TKT-204ENST00000450814 1941 ntTSL 220.66■□□□□ 0.91e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-213ENST00000487660 610 ntTSL 218.56■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-210ENST00000469678 1871 ntTSL 518.29■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.511e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-211ENST00000472528 1055 ntTSL 1 (best)17.04■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 43.1
XRCC6P12956 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 43.1
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