RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581960.1

YES1-204, Transcript of YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase, humanhuman

TSL 3

Gene YES1, Length 487 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YES1-204ENST00000581960 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.42■■■■■ 7.42
YES1-204ENST00000581960 ABCC9O60706 1549 aa55.89■■■■■ 6.54
YES1-204ENST00000581960 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.23■■■■■ 6.43
YES1-204ENST00000581960 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.93■■■■■ 6.06
YES1-204ENST00000581960 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.82■■■■■ 6.05
YES1-204ENST00000581960 NACADO15069 1562 aa52.31■■■■■ 5.96
YES1-204ENST00000581960 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.12■■■■■ 5.93
YES1-204ENST00000581960 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.99■■■■■ 5.91
YES1-204ENST00000581960 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.75■■■■■ 5.87
YES1-204ENST00000581960 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.45■■■■■ 5.83
YES1-204ENST00000581960 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.38■■■■■ 5.82
YES1-204ENST00000581960 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.82■■■■■ 5.73
YES1-204ENST00000581960 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.58■■■■■ 5.69
YES1-204ENST00000581960 SCRIBQ14160 1630 aa50.48■■■■■ 5.67
YES1-204ENST00000581960 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.44■■■■■ 5.66
YES1-204ENST00000581960 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.4■■■■■ 5.66
YES1-204ENST00000581960 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.33■■■■■ 5.65
YES1-204ENST00000581960 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.17■■■■■ 5.62
YES1-204ENST00000581960 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.77■■■■■ 5.4
YES1-204ENST00000581960 NCAPD3P42695 1498 aa48.35■■■■■ 5.33
YES1-204ENST00000581960 CUX2O14529 1486 aa48.19■■■■■ 5.31
YES1-204ENST00000581960 ERCC6Q03468 1493 aa48.19■■■■■ 5.31
YES1-204ENST00000581960 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.19■■■■■ 5.31
YES1-204ENST00000581960 SMARCA4P51532 1647 aa48.03■■■■■ 5.28
YES1-204ENST00000581960 SMARCA2P51531 1590 aa47.94■■■■■ 5.26
YES1-204ENST00000581960 HMGXB3Q12766 1538 aa47.94■■■■■ 5.26
YES1-204ENST00000581960 NESP48681 1621 aa47.93■■■■■ 5.26
YES1-204ENST00000581960 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.68■■■■■ 5.22
YES1-204ENST00000581960 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.65■■■■■ 5.22
YES1-204ENST00000581960 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.49■■■■■ 5.19
YES1-204ENST00000581960 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
YES1-204ENST00000581960 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.41■■■■■ 5.18
YES1-204ENST00000581960 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.31■■■■■ 5.16
YES1-204ENST00000581960 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.22■■■■■ 5.15
YES1-204ENST00000581960 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.03■■■■■ 5.12
YES1-204ENST00000581960 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.86■■■■■ 5.09
YES1-204ENST00000581960 WIZO95785 1651 aa46.83■■■■■ 5.09
YES1-204ENST00000581960 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.73■■■■■ 5.07
YES1-204ENST00000581960 WDR62O43379 1518 aa46.64■■■■■ 5.06
YES1-204ENST00000581960 TRIM41Q8WV44 630 aa46.55■■■■■ 5.04
YES1-204ENST00000581960 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.44■■■■■ 5.03
YES1-204ENST00000581960 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.38■■■■■ 5.02
YES1-204ENST00000581960 CFTRP13569 1480 aa46.25■■■■■ 4.99
YES1-204ENST00000581960 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.21■■■■■ 4.99
YES1-204ENST00000581960 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.11■■■■■ 4.97
YES1-204ENST00000581960 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
YES1-204ENST00000581960 OSCARQ8IYS5 282 aa45.92■■■■■ 4.94
YES1-204ENST00000581960 PRDM2Q13029 1718 aa45.69■■■■■ 4.91
YES1-204ENST00000581960 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
YES1-204ENST00000581960 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.64■■■■■ 4.9
YES1-204ENST00000581960 IFT140Q96RY7 1462 aa45.5■■■■■ 4.87
YES1-204ENST00000581960 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.5■■■■■ 4.87
YES1-204ENST00000581960 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.5■■■■■ 4.87
YES1-204ENST00000581960 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.5■■■■■ 4.87
YES1-204ENST00000581960 TOPBP1Q92547 1522 aa45.47■■■■■ 4.87
YES1-204ENST00000581960 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
YES1-204ENST00000581960 ARHGEF11O15085 1522 aa45.29■■■■■ 4.84
YES1-204ENST00000581960 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.22■■■■■ 4.83
YES1-204ENST00000581960 ABCC8Q09428 1581 aa45.15■■■■■ 4.82
YES1-204ENST00000581960 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.14■■■■■ 4.824e-8■■■■■ 40.1
YES1-204ENST00000581960 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
YES1-204ENST00000581960 CHD1O14646 1710 aa45.06■■■■■ 4.8
YES1-204ENST00000581960 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.99■■■■■ 4.79
YES1-204ENST00000581960 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
YES1-204ENST00000581960 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.91■■■■■ 4.78
YES1-204ENST00000581960 FBLN2P98095 1184 aa44.9■■■■■ 4.78
YES1-204ENST00000581960 ARAP1Q96P48 1450 aa44.85■■■■■ 4.77
YES1-204ENST00000581960 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
YES1-204ENST00000581960 SOGA1O94964 1423 aa44.72■■■■■ 4.75
YES1-204ENST00000581960 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.65■■■■■ 4.74
YES1-204ENST00000581960 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.64■■■■■ 4.74
YES1-204ENST00000581960 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
YES1-204ENST00000581960 CUX1P39880 1505 aa44.56■■■■■ 4.72
YES1-204ENST00000581960 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.51■■■■■ 4.72
YES1-204ENST00000581960 WDR97A6NE52 1622 aa44.42■■■■■ 4.7
YES1-204ENST00000581960 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.42■■■■■ 4.7
YES1-204ENST00000581960 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
YES1-204ENST00000581960 GRIN2BQ13224 1484 aa44.37■■■■■ 4.69
YES1-204ENST00000581960 SYNJ1O43426 1573 aa44.35■■■■■ 4.69
YES1-204ENST00000581960 SYNJ2O15056 1496 aa44.28■■■■■ 4.68
YES1-204ENST00000581960 PBRM1Q86U86 1689 aa44.21■■■■■ 4.67
YES1-204ENST00000581960 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.17■■■■■ 4.66
YES1-204ENST00000581960 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.06■■■■■ 4.64
YES1-204ENST00000581960 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.04■■■■■ 4.64
YES1-204ENST00000581960 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.92■■■■■ 4.62
YES1-204ENST00000581960 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.62
YES1-204ENST00000581960 GRIN2AQ12879 1464 aa43.83■■■■■ 4.61
YES1-204ENST00000581960 ADAMTS12P58397 1594 aa43.78■■■■■ 4.6
YES1-204ENST00000581960 CEP170Q5SW79 1584 aa43.76■■■■■ 4.6
YES1-204ENST00000581960 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.73■■■■■ 4.59
YES1-204ENST00000581960 NUP160Q12769 1436 aa43.7■■■■■ 4.59
YES1-204ENST00000581960 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.65■■■■■ 4.58
YES1-204ENST00000581960 TOP2BQ02880 1626 aa43.63■■■■■ 4.58
YES1-204ENST00000581960 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
YES1-204ENST00000581960 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.56■■■■■ 4.56
YES1-204ENST00000581960 SHROOM2Q13796 1616 aa43.56■■■■■ 4.56
YES1-204ENST00000581960 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.44■■■■■ 4.54
YES1-204ENST00000581960 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
YES1-204ENST00000581960 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.27■■■■■ 4.52
YES1-204ENST00000581960 JPH4Q96JJ6 628 aa43.22■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms