RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635970.1

CLN8-209, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN8, Length 1,958 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-209ENST00000635970 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.09■■■■□ 3.37
CLN8-209ENST00000635970 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32■■■□□ 2.71
CLN8-209ENST00000635970 ABCC9O60706 1549 aa31.08■■■□□ 2.57
CLN8-209ENST00000635970 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
CLN8-209ENST00000635970 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.04■■■□□ 2.4
CLN8-209ENST00000635970 NACADO15069 1562 aa29.96■■■□□ 2.39
CLN8-209ENST00000635970 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.96■■■□□ 2.39
CLN8-209ENST00000635970 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.83■■■□□ 2.37
CLN8-209ENST00000635970 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.82■■■□□ 2.36
CLN8-209ENST00000635970 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.44■■■□□ 2.3
CLN8-209ENST00000635970 SCRIBQ14160 1630 aa29.29■■■□□ 2.28
CLN8-209ENST00000635970 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.11■■■□□ 2.25
CLN8-209ENST00000635970 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
CLN8-209ENST00000635970 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.74■■■□□ 2.19
CLN8-209ENST00000635970 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CLN8-209ENST00000635970 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.26■■■□□ 2.11
CLN8-209ENST00000635970 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.14■■■□□ 2.09
CLN8-209ENST00000635970 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.13■■■□□ 2.09
CLN8-209ENST00000635970 SMARCA4P51532 1647 aa28■■■□□ 2.07
CLN8-209ENST00000635970 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
CLN8-209ENST00000635970 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.86■■■□□ 2.05
CLN8-209ENST00000635970 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.72■■■□□ 2.03
CLN8-209ENST00000635970 SMARCA2P51531 1590 aa27.69■■■□□ 2.02
CLN8-209ENST00000635970 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.67■■■□□ 2.02
CLN8-209ENST00000635970 WIZO95785 1651 aa27.63■■■□□ 2.01
CLN8-209ENST00000635970 NCAPD3P42695 1498 aa27.62■■■□□ 2.01
CLN8-209ENST00000635970 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CLN8-209ENST00000635970 HMGXB3Q12766 1538 aa27.56■■■□□ 2
CLN8-209ENST00000635970 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CLN8-209ENST00000635970 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
CLN8-209ENST00000635970 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CLN8-209ENST00000635970 NESP48681 1621 aa27■■□□□ 1.91
CLN8-209ENST00000635970 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.94■■□□□ 1.9
CLN8-209ENST00000635970 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.9■■□□□ 1.9
CLN8-209ENST00000635970 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.84■■□□□ 1.89
CLN8-209ENST00000635970 CFTRP13569 1480 aa26.76■■□□□ 1.87
CLN8-209ENST00000635970 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.74■■□□□ 1.87
CLN8-209ENST00000635970 ERCC6Q03468 1493 aa26.73■■□□□ 1.87
CLN8-209ENST00000635970 PRDM2Q13029 1718 aa26.7■■□□□ 1.87
CLN8-209ENST00000635970 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.66■■□□□ 1.86
CLN8-209ENST00000635970 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.57■■□□□ 1.84
CLN8-209ENST00000635970 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CLN8-209ENST00000635970 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.52■■□□□ 1.84
CLN8-209ENST00000635970 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.42■■□□□ 1.82
CLN8-209ENST00000635970 WDR62O43379 1518 aa26.35■■□□□ 1.81
CLN8-209ENST00000635970 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CLN8-209ENST00000635970 CUX2O14529 1486 aa26.31■■□□□ 1.8
CLN8-209ENST00000635970 TOPBP1Q92547 1522 aa26.19■■□□□ 1.78
CLN8-209ENST00000635970 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.19■■□□□ 1.78
CLN8-209ENST00000635970 ABCC8Q09428 1581 aa26.13■■□□□ 1.77
CLN8-209ENST00000635970 CUX1P39880 1505 aa26.12■■□□□ 1.77
CLN8-209ENST00000635970 SYNJ1O43426 1573 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN8-209ENST00000635970 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
CLN8-209ENST00000635970 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CLN8-209ENST00000635970 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.98■■□□□ 1.75
CLN8-209ENST00000635970 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.97■■□□□ 1.75
CLN8-209ENST00000635970 TOP2BQ02880 1626 aa25.96■■□□□ 1.75
CLN8-209ENST00000635970 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CLN8-209ENST00000635970 IFT140Q96RY7 1462 aa25.92■■□□□ 1.74
CLN8-209ENST00000635970 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.9■■□□□ 1.74
CLN8-209ENST00000635970 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CLN8-209ENST00000635970 SOGA1O94964 1423 aa25.84■■□□□ 1.73
CLN8-209ENST00000635970 WDR97A6NE52 1622 aa25.82■■□□□ 1.72
CLN8-209ENST00000635970 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CLN8-209ENST00000635970 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
CLN8-209ENST00000635970 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.7■■□□□ 1.71
CLN8-209ENST00000635970 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CLN8-209ENST00000635970 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.64■■□□□ 1.7
CLN8-209ENST00000635970 PBRM1Q86U86 1689 aa25.61■■□□□ 1.69
CLN8-209ENST00000635970 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.57■■□□□ 1.68
CLN8-209ENST00000635970 TRIM41Q8WV44 630 aa25.53■■□□□ 1.68
CLN8-209ENST00000635970 GRIN2BQ13224 1484 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN8-209ENST00000635970 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.5■■□□□ 1.67
CLN8-209ENST00000635970 CHD1O14646 1710 aa25.46■■□□□ 1.67
CLN8-209ENST00000635970 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CLN8-209ENST00000635970 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.42■■□□□ 1.66
CLN8-209ENST00000635970 KIF27Q86VH2 1401 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN8-209ENST00000635970 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN8-209ENST00000635970 ADAMTS12P58397 1594 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN8-209ENST00000635970 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.36■■□□□ 1.65
CLN8-209ENST00000635970 SYNJ2O15056 1496 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN8-209ENST00000635970 FBLN2P98095 1184 aa25.33■■□□□ 1.64
CLN8-209ENST00000635970 IGF1RP08069 1367 aa25.27■■□□□ 1.64
CLN8-209ENST00000635970 CUL7Q14999 1698 aa25.26■■□□□ 1.63
CLN8-209ENST00000635970 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CLN8-209ENST00000635970 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.25■■□□□ 1.63
CLN8-209ENST00000635970 OSCARQ8IYS5 282 aa25.23■■□□□ 1.63
CLN8-209ENST00000635970 GRIN2AQ12879 1464 aa25.22■■□□□ 1.63
CLN8-209ENST00000635970 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.16■■□□□ 1.62
CLN8-209ENST00000635970 CEP170Q5SW79 1584 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN8-209ENST00000635970 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.13■■□□□ 1.61
CLN8-209ENST00000635970 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.11■■□□□ 1.61
CLN8-209ENST00000635970 NUP160Q12769 1436 aa25.07■■□□□ 1.6
CLN8-209ENST00000635970 HRCP23327 699 aa25.07■■□□□ 1.6
CLN8-209ENST00000635970 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CLN8-209ENST00000635970 EEA1Q15075 1411 aa25.06■■□□□ 1.6
CLN8-209ENST00000635970 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.03■■□□□ 1.6
CLN8-209ENST00000635970 PRXQ9BXM0 1461 aa25.01■■□□□ 1.59
CLN8-209ENST00000635970 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25■■□□□ 1.59
CLN8-209ENST00000635970 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.94■■□□□ 1.58
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