RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568288.5

UBE2I-218, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 I, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2I, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2I-218ENST00000568288 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.69■■■■■ 4.27
UBE2I-218ENST00000568288 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.86■■■■□ 3.49
UBE2I-218ENST00000568288 ABCC9O60706 1549 aa35.7■■■■□ 3.31
UBE2I-218ENST00000568288 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
UBE2I-218ENST00000568288 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.79■■■■□ 3.16
UBE2I-218ENST00000568288 NACADO15069 1562 aa34.52■■■■□ 3.12
UBE2I-218ENST00000568288 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.48■■■■□ 3.11
UBE2I-218ENST00000568288 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.44■■■■□ 3.1
UBE2I-218ENST00000568288 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.38■■■■□ 3.09
UBE2I-218ENST00000568288 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.82■■■■□ 3
UBE2I-218ENST00000568288 SCRIBQ14160 1630 aa33.78■■■■□ 3
UBE2I-218ENST00000568288 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.46■■■□□ 2.95
UBE2I-218ENST00000568288 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.43■■■□□ 2.94
UBE2I-218ENST00000568288 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.37■■■□□ 2.93
UBE2I-218ENST00000568288 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
UBE2I-218ENST00000568288 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.48■■■□□ 2.79
UBE2I-218ENST00000568288 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.32■■■□□ 2.76
UBE2I-218ENST00000568288 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.29■■■□□ 2.76
UBE2I-218ENST00000568288 SMARCA4P51532 1647 aa32.29■■■□□ 2.76
UBE2I-218ENST00000568288 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
UBE2I-218ENST00000568288 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.19■■■□□ 2.74
UBE2I-218ENST00000568288 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.96■■■□□ 2.71
UBE2I-218ENST00000568288 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
UBE2I-218ENST00000568288 SMARCA2P51531 1590 aa31.94■■■□□ 2.7
UBE2I-218ENST00000568288 WIZO95785 1651 aa31.92■■■□□ 2.7
UBE2I-218ENST00000568288 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.88■■■□□ 2.69
UBE2I-218ENST00000568288 NCAPD3P42695 1498 aa31.82■■■□□ 2.68
UBE2I-218ENST00000568288 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
UBE2I-218ENST00000568288 HMGXB3Q12766 1538 aa31.73■■■□□ 2.67
UBE2I-218ENST00000568288 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
UBE2I-218ENST00000568288 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
UBE2I-218ENST00000568288 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.17■■■□□ 2.58
UBE2I-218ENST00000568288 NESP48681 1621 aa31.04■■■□□ 2.56
UBE2I-218ENST00000568288 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.95■■■□□ 2.55
UBE2I-218ENST00000568288 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.95■■■□□ 2.54
UBE2I-218ENST00000568288 CFTRP13569 1480 aa30.85■■■□□ 2.53
UBE2I-218ENST00000568288 PRDM2Q13029 1718 aa30.77■■■□□ 2.52
UBE2I-218ENST00000568288 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.72■■■□□ 2.51
UBE2I-218ENST00000568288 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.71■■■□□ 2.51
UBE2I-218ENST00000568288 ERCC6Q03468 1493 aa30.71■■■□□ 2.51
UBE2I-218ENST00000568288 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.63■■■□□ 2.49
UBE2I-218ENST00000568288 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.56■■■□□ 2.48
UBE2I-218ENST00000568288 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
UBE2I-218ENST00000568288 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.4■■■□□ 2.46
UBE2I-218ENST00000568288 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
UBE2I-218ENST00000568288 WDR62O43379 1518 aa30.27■■■□□ 2.44
UBE2I-218ENST00000568288 ABCC8Q09428 1581 aa30.25■■■□□ 2.43
UBE2I-218ENST00000568288 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.2■■■□□ 2.43
UBE2I-218ENST00000568288 TOPBP1Q92547 1522 aa30.2■■■□□ 2.42
UBE2I-218ENST00000568288 CUX1P39880 1505 aa30.17■■■□□ 2.42
UBE2I-218ENST00000568288 CUX2O14529 1486 aa30.13■■■□□ 2.41
UBE2I-218ENST00000568288 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
UBE2I-218ENST00000568288 SYNJ1O43426 1573 aa30.07■■■□□ 2.4
UBE2I-218ENST00000568288 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.03■■■□□ 2.4
UBE2I-218ENST00000568288 TOP2BQ02880 1626 aa30.01■■■□□ 2.39
UBE2I-218ENST00000568288 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.99■■■□□ 2.39
UBE2I-218ENST00000568288 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
UBE2I-218ENST00000568288 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.88■■■□□ 2.37
UBE2I-218ENST00000568288 SOGA1O94964 1423 aa29.87■■■□□ 2.37
UBE2I-218ENST00000568288 IFT140Q96RY7 1462 aa29.87■■■□□ 2.37
UBE2I-218ENST00000568288 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
UBE2I-218ENST00000568288 TRIM41Q8WV44 630 aa29.78■■■□□ 2.36
UBE2I-218ENST00000568288 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
UBE2I-218ENST00000568288 WDR97A6NE52 1622 aa29.73■■■□□ 2.35
UBE2I-218ENST00000568288 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.72■■■□□ 2.35
UBE2I-218ENST00000568288 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.67■■■□□ 2.34
UBE2I-218ENST00000568288 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
UBE2I-218ENST00000568288 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
UBE2I-218ENST00000568288 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.341e-6■■■□□ 19.2
UBE2I-218ENST00000568288 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.55■■■□□ 2.32
UBE2I-218ENST00000568288 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.53■■■□□ 2.32
UBE2I-218ENST00000568288 PBRM1Q86U86 1689 aa29.51■■■□□ 2.31
UBE2I-218ENST00000568288 KIF27Q86VH2 1401 aa29.45■■■□□ 2.3
UBE2I-218ENST00000568288 GRIN2BQ13224 1484 aa29.43■■■□□ 2.3
UBE2I-218ENST00000568288 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.41■■■□□ 2.3
UBE2I-218ENST00000568288 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.37■■■□□ 2.29
UBE2I-218ENST00000568288 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.32■■■□□ 2.28
UBE2I-218ENST00000568288 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
UBE2I-218ENST00000568288 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
UBE2I-218ENST00000568288 IGF1RP08069 1367 aa29.26■■■□□ 2.27
UBE2I-218ENST00000568288 CHD1O14646 1710 aa29.25■■■□□ 2.27
UBE2I-218ENST00000568288 ADAMTS12P58397 1594 aa29.24■■■□□ 2.27
UBE2I-218ENST00000568288 FBLN2P98095 1184 aa29.24■■■□□ 2.27
UBE2I-218ENST00000568288 CUL7Q14999 1698 aa29.19■■■□□ 2.26
UBE2I-218ENST00000568288 SYNJ2O15056 1496 aa29.18■■■□□ 2.26
UBE2I-218ENST00000568288 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
UBE2I-218ENST00000568288 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.18■■■□□ 2.26
UBE2I-218ENST00000568288 EEA1Q15075 1411 aa29.16■■■□□ 2.26
UBE2I-218ENST00000568288 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.13■■■□□ 2.25
UBE2I-218ENST00000568288 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.11■■■□□ 2.25
UBE2I-218ENST00000568288 GRIN2AQ12879 1464 aa29.07■■■□□ 2.24
UBE2I-218ENST00000568288 OSCARQ8IYS5 282 aa29.02■■■□□ 2.24
UBE2I-218ENST00000568288 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.99■■■□□ 2.23
UBE2I-218ENST00000568288 PRXQ9BXM0 1461 aa28.97■■■□□ 2.23
UBE2I-218ENST00000568288 CEP170Q5SW79 1584 aa28.94■■■□□ 2.22
UBE2I-218ENST00000568288 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.91■■■□□ 2.22
UBE2I-218ENST00000568288 NUP160Q12769 1436 aa28.88■■■□□ 2.21
UBE2I-218ENST00000568288 KIF21BO75037 1637 aa28.88■■■□□ 2.21
UBE2I-218ENST00000568288 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.84■■■□□ 2.21
UBE2I-218ENST00000568288 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms