Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EPB41P11171 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EPB41P11171 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EPB41P11171 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EPB41P11171 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EPB41P11171 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
EPB41P11171 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EPB41P11171 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EPB41P11171 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EPB41P11171 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EPB41P11171 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EPB41P11171 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EPB41P11171 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
EPB41P11171 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EPB41P11171 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EPB41P11171 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EPB41P11171 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EPB41P11171 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EPB41P11171 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EPB41P11171 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EPB41P11171 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EPB41P11171 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EPB41P11171 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EPB41P11171 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
EPB41P11171 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EPB41P11171 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EPB41P11171 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EPB41P11171 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EPB41P11171 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EPB41P11171 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EPB41P11171 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EPB41P11171 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EPB41P11171 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EPB41P11171 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EPB41P11171 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EPB41P11171 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EPB41P11171 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EPB41P11171 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EPB41P11171 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EPB41P11171 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EPB41P11171 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EPB41P11171 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EPB41P11171 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EPB41P11171 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EPB41P11171 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EPB41P11171 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EPB41P11171 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EPB41P11171 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
EPB41P11171 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EPB41P11171 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EPB41P11171 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EPB41P11171 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EPB41P11171 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EPB41P11171 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EPB41P11171 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EPB41P11171 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EPB41P11171 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
EPB41P11171 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EPB41P11171 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EPB41P11171 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EPB41P11171 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EPB41P11171 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EPB41P11171 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EPB41P11171 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EPB41P11171 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EPB41P11171 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EPB41P11171 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EPB41P11171 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EPB41P11171 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EPB41P11171 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EPB41P11171 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EPB41P11171 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
EPB41P11171 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EPB41P11171 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EPB41P11171 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EPB41P11171 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EPB41P11171 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EPB41P11171 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EPB41P11171 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EPB41P11171 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EPB41P11171 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EPB41P11171 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EPB41P11171 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EPB41P11171 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EPB41P11171 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EPB41P11171 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EPB41P11171 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EPB41P11171 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EPB41P11171 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EPB41P11171 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EPB41P11171 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EPB41P11171 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EPB41P11171 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EPB41P11171 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EPB41P11171 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EPB41P11171 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EPB41P11171 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EPB41P11171 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EPB41P11171 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EPB41P11171 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms