Protein–RNA interactions for Protein: P01817

IGHV2-5, Immunoglobulin heavy variable 2-5, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV2-5P01817 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV2-5P01817 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGHV2-5P01817 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGHV2-5P01817 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGHV2-5P01817 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IGHV2-5P01817 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV2-5P01817 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV2-5P01817 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV2-5P01817 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHV2-5P01817 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHV2-5P01817 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHV2-5P01817 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV2-5P01817 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV2-5P01817 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV2-5P01817 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGHV2-5P01817 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHV2-5P01817 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHV2-5P01817 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV2-5P01817 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV2-5P01817 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV2-5P01817 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV2-5P01817 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV2-5P01817 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV2-5P01817 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHV2-5P01817 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHV2-5P01817 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV2-5P01817 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV2-5P01817 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV2-5P01817 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV2-5P01817 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV2-5P01817 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV2-5P01817 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV2-5P01817 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHV2-5P01817 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHV2-5P01817 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHV2-5P01817 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHV2-5P01817 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHV2-5P01817 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHV2-5P01817 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHV2-5P01817 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHV2-5P01817 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHV2-5P01817 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHV2-5P01817 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHV2-5P01817 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHV2-5P01817 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHV2-5P01817 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHV2-5P01817 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHV2-5P01817 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHV2-5P01817 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHV2-5P01817 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV2-5P01817 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV2-5P01817 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGHV2-5P01817 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV2-5P01817 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV2-5P01817 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV2-5P01817 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV2-5P01817 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV2-5P01817 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV2-5P01817 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV2-5P01817 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV2-5P01817 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV2-5P01817 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV2-5P01817 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV2-5P01817 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGHV2-5P01817 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGHV2-5P01817 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGHV2-5P01817 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV2-5P01817 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV2-5P01817 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV2-5P01817 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV2-5P01817 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV2-5P01817 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV2-5P01817 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV2-5P01817 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV2-5P01817 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV2-5P01817 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV2-5P01817 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV2-5P01817 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV2-5P01817 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV2-5P01817 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV2-5P01817 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV2-5P01817 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGHV2-5P01817 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV2-5P01817 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV2-5P01817 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV2-5P01817 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV2-5P01817 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms