Protein–RNA interactions for Protein: P01817

IGHV2-5, Immunoglobulin heavy variable 2-5, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV2-5P01817 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGHV2-5P01817 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHV2-5P01817 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGHV2-5P01817 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
IGHV2-5P01817 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGHV2-5P01817 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGHV2-5P01817 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IGHV2-5P01817 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGHV2-5P01817 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGHV2-5P01817 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGHV2-5P01817 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGHV2-5P01817 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHV2-5P01817 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHV2-5P01817 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHV2-5P01817 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGHV2-5P01817 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGHV2-5P01817 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGHV2-5P01817 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGHV2-5P01817 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGHV2-5P01817 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGHV2-5P01817 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGHV2-5P01817 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGHV2-5P01817 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGHV2-5P01817 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGHV2-5P01817 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGHV2-5P01817 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGHV2-5P01817 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGHV2-5P01817 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGHV2-5P01817 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHV2-5P01817 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHV2-5P01817 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGHV2-5P01817 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGHV2-5P01817 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGHV2-5P01817 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHV2-5P01817 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHV2-5P01817 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHV2-5P01817 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGHV2-5P01817 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGHV2-5P01817 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGHV2-5P01817 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGHV2-5P01817 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHV2-5P01817 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHV2-5P01817 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHV2-5P01817 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGHV2-5P01817 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGHV2-5P01817 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHV2-5P01817 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHV2-5P01817 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHV2-5P01817 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGHV2-5P01817 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGHV2-5P01817 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGHV2-5P01817 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IGHV2-5P01817 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHV2-5P01817 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHV2-5P01817 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHV2-5P01817 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHV2-5P01817 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHV2-5P01817 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHV2-5P01817 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHV2-5P01817 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHV2-5P01817 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHV2-5P01817 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHV2-5P01817 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHV2-5P01817 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHV2-5P01817 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IGHV2-5P01817 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHV2-5P01817 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHV2-5P01817 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHV2-5P01817 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHV2-5P01817 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHV2-5P01817 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHV2-5P01817 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGHV2-5P01817 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHV2-5P01817 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHV2-5P01817 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHV2-5P01817 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHV2-5P01817 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHV2-5P01817 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGHV2-5P01817 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGHV2-5P01817 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGHV2-5P01817 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IGHV2-5P01817 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGHV2-5P01817 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGHV2-5P01817 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGHV2-5P01817 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGHV2-5P01817 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGHV2-5P01817 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGHV2-5P01817 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGHV2-5P01817 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGHV2-5P01817 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGHV2-5P01817 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGHV2-5P01817 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGHV2-5P01817 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGHV2-5P01817 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGHV2-5P01817 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHV2-5P01817 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGHV2-5P01817 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHV2-5P01817 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHV2-5P01817 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGHV2-5P01817 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms