RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372359.9

ARTN-202, Transcript of artemin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARTN, Length 1,921 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARTN-202ENST00000372359 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.61■■■■■ 8.09
ARTN-202ENST00000372359 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.35■■■■■ 6.77
ARTN-202ENST00000372359 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.05■■■■■ 6.4
ARTN-202ENST00000372359 ABCC9O60706 1549 aa54.58■■■■■ 6.33
ARTN-202ENST00000372359 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.31■■■■■ 6.28
ARTN-202ENST00000372359 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.26■■■■■ 6.28
ARTN-202ENST00000372359 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.76■■■■■ 6.2
ARTN-202ENST00000372359 NACADO15069 1562 aa53.53■■■■■ 6.16
ARTN-202ENST00000372359 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.26■■■■■ 6.12
ARTN-202ENST00000372359 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.15■■■■■ 6.1
ARTN-202ENST00000372359 SCRIBQ14160 1630 aa52.7■■■■■ 6.03
ARTN-202ENST00000372359 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.02■■■■■ 5.92
ARTN-202ENST00000372359 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.56■■■■■ 5.84
ARTN-202ENST00000372359 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.42■■■■■ 5.82
ARTN-202ENST00000372359 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.07■■■■■ 5.77
ARTN-202ENST00000372359 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.02■■■■■ 5.76
ARTN-202ENST00000372359 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.78■■■■■ 5.72
ARTN-202ENST00000372359 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.68■■■■■ 5.7
ARTN-202ENST00000372359 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.67■■■■■ 5.7
ARTN-202ENST00000372359 SMARCA4P51532 1647 aa50.5■■■■■ 5.67
ARTN-202ENST00000372359 WIZO95785 1651 aa50.23■■■■■ 5.63
ARTN-202ENST00000372359 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.04■■■■■ 5.6
ARTN-202ENST00000372359 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.92■■■■■ 5.58
ARTN-202ENST00000372359 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.79■■■■■ 5.56
ARTN-202ENST00000372359 SMARCA2P51531 1590 aa49.73■■■■■ 5.55
ARTN-202ENST00000372359 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.71■■■■■ 5.55
ARTN-202ENST00000372359 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.47■■■■■ 5.51
ARTN-202ENST00000372359 NCAPD3P42695 1498 aa49.43■■■■■ 5.5
ARTN-202ENST00000372359 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.39■■■■■ 5.5
ARTN-202ENST00000372359 HMGXB3Q12766 1538 aa49.31■■■■■ 5.48
ARTN-202ENST00000372359 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.21■■■■■ 5.47
ARTN-202ENST00000372359 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.71■■■■■ 5.39
ARTN-202ENST00000372359 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.5■■■■■ 5.35
ARTN-202ENST00000372359 CFTRP13569 1480 aa48.23■■■■■ 5.31
ARTN-202ENST00000372359 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.14■■■■■ 5.3
ARTN-202ENST00000372359 TRIM41Q8WV44 630 aa48.06■■■■■ 5.28
ARTN-202ENST00000372359 ABCC8Q09428 1581 aa48.04■■■■■ 5.28
ARTN-202ENST00000372359 PRDM2Q13029 1718 aa47.88■■■■■ 5.26
ARTN-202ENST00000372359 NESP48681 1621 aa47.82■■■■■ 5.25
ARTN-202ENST00000372359 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.79■■■■■ 5.24
ARTN-202ENST00000372359 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.78■■■■■ 5.24
ARTN-202ENST00000372359 SYNJ1O43426 1573 aa47.6■■■■■ 5.21
ARTN-202ENST00000372359 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.59■■■■■ 5.21
ARTN-202ENST00000372359 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.45■■■■■ 5.19
ARTN-202ENST00000372359 TOP2BQ02880 1626 aa47.44■■■■■ 5.18
ARTN-202ENST00000372359 CUX1P39880 1505 aa47.41■■■■■ 5.18
ARTN-202ENST00000372359 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.37■■■■■ 5.17
ARTN-202ENST00000372359 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.32■■■■■ 5.17
ARTN-202ENST00000372359 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.2■■■■■ 5.15
ARTN-202ENST00000372359 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.15■■■■■ 5.14
ARTN-202ENST00000372359 SOGA1O94964 1423 aa47.09■■■■■ 5.13
ARTN-202ENST00000372359 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.08■■■■■ 5.13
ARTN-202ENST00000372359 TOPBP1Q92547 1522 aa47.03■■■■■ 5.12
ARTN-202ENST00000372359 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
ARTN-202ENST00000372359 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.94■■■■■ 5.11
ARTN-202ENST00000372359 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.93■■■■■ 5.1
ARTN-202ENST00000372359 EEA1Q15075 1411 aa46.91■■■■■ 5.1
ARTN-202ENST00000372359 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.84■■■■■ 5.09
ARTN-202ENST00000372359 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.83■■■■■ 5.09
ARTN-202ENST00000372359 ERCC6Q03468 1493 aa46.83■■■■■ 5.09
ARTN-202ENST00000372359 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
ARTN-202ENST00000372359 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.71■■■■■ 5.07
ARTN-202ENST00000372359 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.63■■■■■ 5.05
ARTN-202ENST00000372359 KIF27Q86VH2 1401 aa46.62■■■■■ 5.05
ARTN-202ENST00000372359 WDR62O43379 1518 aa46.61■■■■■ 5.05
ARTN-202ENST00000372359 CUX2O14529 1486 aa46.58■■■■■ 5.05
ARTN-202ENST00000372359 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
ARTN-202ENST00000372359 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.53■■■■■ 5.04
ARTN-202ENST00000372359 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.5■■■■■ 5.03
ARTN-202ENST00000372359 WDR97A6NE52 1622 aa46.37■■■■■ 5.01
ARTN-202ENST00000372359 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
ARTN-202ENST00000372359 KIF21BO75037 1637 aa46.3■■■■■ 5
ARTN-202ENST00000372359 IGF1RP08069 1367 aa46.27■■■■■ 5
ARTN-202ENST00000372359 GOLGA3Q08378 1498 aa46.24■■■■■ 4.99
ARTN-202ENST00000372359 PRXQ9BXM0 1461 aa46.23■■■■■ 4.99
ARTN-202ENST00000372359 IFT140Q96RY7 1462 aa46.22■■■■■ 4.99
ARTN-202ENST00000372359 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.22■■■■■ 4.99
ARTN-202ENST00000372359 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.16■■■■■ 4.98
ARTN-202ENST00000372359 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.14■■■■■ 4.98
ARTN-202ENST00000372359 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.11■■■■■ 4.97
ARTN-202ENST00000372359 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.08■■■■■ 4.97
ARTN-202ENST00000372359 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.07■■■■■ 4.97
ARTN-202ENST00000372359 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.04■■■■■ 4.96
ARTN-202ENST00000372359 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.01■■■■■ 4.96
ARTN-202ENST00000372359 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.99■■■■■ 4.95
ARTN-202ENST00000372359 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
ARTN-202ENST00000372359 CUL7Q14999 1698 aa45.89■■■■■ 4.94
ARTN-202ENST00000372359 PBRM1Q86U86 1689 aa45.82■■■■■ 4.93
ARTN-202ENST00000372359 GRIN2BQ13224 1484 aa45.8■■■■■ 4.92
ARTN-202ENST00000372359 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
ARTN-202ENST00000372359 CEP162Q5TB80 1403 aa45.76■■■■■ 4.92
ARTN-202ENST00000372359 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.61■■■■■ 4.89
ARTN-202ENST00000372359 ADAMTS12P58397 1594 aa45.59■■■■■ 4.89
ARTN-202ENST00000372359 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.54■■■■■ 4.88
ARTN-202ENST00000372359 CLIP1P30622 1438 aa45.5■■■■■ 4.87
ARTN-202ENST00000372359 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
ARTN-202ENST00000372359 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
ARTN-202ENST00000372359 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.3■■■■■ 4.84
ARTN-202ENST00000372359 SYNJ2O15056 1496 aa45.29■■■■■ 4.84
ARTN-202ENST00000372359 GRIN2AQ12879 1464 aa45.24■■■■■ 4.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms