Protein–RNA interactions for Protein: O95947

TBX6, T-box transcription factor TBX6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX6O95947 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TBX6O95947 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TBX6O95947 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TBX6O95947 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TBX6O95947 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TBX6O95947 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TBX6O95947 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TBX6O95947 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TBX6O95947 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TBX6O95947 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TBX6O95947 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TBX6O95947 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TBX6O95947 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TBX6O95947 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TBX6O95947 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBX6O95947 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBX6O95947 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBX6O95947 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBX6O95947 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBX6O95947 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBX6O95947 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TBX6O95947 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TBX6O95947 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TBX6O95947 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TBX6O95947 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TBX6O95947 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TBX6O95947 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TBX6O95947 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TBX6O95947 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TBX6O95947 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TBX6O95947 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TBX6O95947 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TBX6O95947 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TBX6O95947 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TBX6O95947 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TBX6O95947 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TBX6O95947 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TBX6O95947 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TBX6O95947 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TBX6O95947 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TBX6O95947 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TBX6O95947 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TBX6O95947 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TBX6O95947 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TBX6O95947 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TBX6O95947 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TBX6O95947 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TBX6O95947 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TBX6O95947 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TBX6O95947 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TBX6O95947 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TBX6O95947 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TBX6O95947 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TBX6O95947 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TBX6O95947 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TBX6O95947 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TBX6O95947 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TBX6O95947 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TBX6O95947 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TBX6O95947 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TBX6O95947 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TBX6O95947 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TBX6O95947 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TBX6O95947 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TBX6O95947 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TBX6O95947 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TBX6O95947 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TBX6O95947 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TBX6O95947 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TBX6O95947 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TBX6O95947 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBX6O95947 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBX6O95947 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX6O95947 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX6O95947 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX6O95947 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBX6O95947 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TBX6O95947 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBX6O95947 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBX6O95947 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TBX6O95947 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TBX6O95947 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TBX6O95947 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TBX6O95947 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBX6O95947 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBX6O95947 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBX6O95947 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TBX6O95947 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBX6O95947 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBX6O95947 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TBX6O95947 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBX6O95947 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBX6O95947 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBX6O95947 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBX6O95947 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBX6O95947 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBX6O95947 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBX6O95947 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBX6O95947 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TBX6O95947 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms