Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MATN4O95460 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MATN4O95460 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MATN4O95460 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MATN4O95460 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MATN4O95460 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MATN4O95460 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MATN4O95460 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MATN4O95460 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MATN4O95460 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MATN4O95460 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MATN4O95460 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MATN4O95460 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MATN4O95460 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MATN4O95460 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MATN4O95460 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MATN4O95460 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MATN4O95460 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MATN4O95460 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MATN4O95460 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MATN4O95460 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MATN4O95460 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MATN4O95460 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MATN4O95460 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MATN4O95460 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MATN4O95460 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MATN4O95460 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MATN4O95460 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MATN4O95460 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MATN4O95460 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MATN4O95460 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MATN4O95460 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MATN4O95460 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MATN4O95460 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MATN4O95460 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MATN4O95460 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MATN4O95460 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MATN4O95460 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MATN4O95460 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MATN4O95460 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MATN4O95460 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MATN4O95460 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MATN4O95460 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MATN4O95460 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MATN4O95460 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MATN4O95460 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MATN4O95460 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MATN4O95460 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MATN4O95460 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MATN4O95460 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MATN4O95460 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MATN4O95460 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MATN4O95460 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MATN4O95460 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MATN4O95460 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MATN4O95460 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MATN4O95460 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MATN4O95460 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MATN4O95460 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MATN4O95460 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MATN4O95460 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MATN4O95460 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MATN4O95460 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MATN4O95460 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MATN4O95460 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MATN4O95460 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MATN4O95460 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MATN4O95460 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MATN4O95460 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MATN4O95460 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MATN4O95460 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MATN4O95460 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MATN4O95460 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MATN4O95460 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MATN4O95460 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MATN4O95460 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MATN4O95460 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MATN4O95460 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MATN4O95460 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MATN4O95460 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MATN4O95460 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MATN4O95460 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MATN4O95460 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MATN4O95460 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MATN4O95460 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MATN4O95460 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MATN4O95460 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MATN4O95460 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MATN4O95460 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MATN4O95460 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MATN4O95460 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MATN4O95460 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MATN4O95460 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MATN4O95460 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MATN4O95460 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MATN4O95460 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MATN4O95460 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MATN4O95460 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MATN4O95460 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MATN4O95460 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms