Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJB6O95452 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GJB6O95452 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GJB6O95452 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB6O95452 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB6O95452 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB6O95452 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB6O95452 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB6O95452 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB6O95452 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJB6O95452 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJB6O95452 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB6O95452 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB6O95452 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJB6O95452 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJB6O95452 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB6O95452 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB6O95452 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB6O95452 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB6O95452 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB6O95452 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB6O95452 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB6O95452 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB6O95452 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB6O95452 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB6O95452 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB6O95452 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB6O95452 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJB6O95452 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJB6O95452 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJB6O95452 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB6O95452 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB6O95452 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB6O95452 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB6O95452 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB6O95452 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB6O95452 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJB6O95452 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJB6O95452 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJB6O95452 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJB6O95452 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJB6O95452 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJB6O95452 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJB6O95452 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJB6O95452 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJB6O95452 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJB6O95452 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB6O95452 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB6O95452 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB6O95452 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB6O95452 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJB6O95452 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJB6O95452 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJB6O95452 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJB6O95452 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GJB6O95452 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJB6O95452 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJB6O95452 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJB6O95452 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GJB6O95452 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB6O95452 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB6O95452 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB6O95452 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GJB6O95452 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJB6O95452 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJB6O95452 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJB6O95452 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJB6O95452 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJB6O95452 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJB6O95452 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJB6O95452 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJB6O95452 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJB6O95452 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJB6O95452 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB6O95452 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB6O95452 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJB6O95452 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJB6O95452 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB6O95452 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB6O95452 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB6O95452 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB6O95452 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB6O95452 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB6O95452 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB6O95452 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB6O95452 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJB6O95452 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJB6O95452 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB6O95452 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB6O95452 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJB6O95452 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB6O95452 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJB6O95452 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB6O95452 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB6O95452 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB6O95452 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB6O95452 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB6O95452 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB6O95452 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB6O95452 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms