Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCELO95171 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCELO95171 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCELO95171 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCELO95171 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCELO95171 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCELO95171 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCELO95171 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCELO95171 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCELO95171 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCELO95171 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCELO95171 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCELO95171 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCELO95171 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCELO95171 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCELO95171 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCELO95171 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCELO95171 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCELO95171 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCELO95171 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCELO95171 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCELO95171 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCELO95171 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCELO95171 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCELO95171 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SCELO95171 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCELO95171 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCELO95171 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCELO95171 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCELO95171 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCELO95171 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCELO95171 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCELO95171 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCELO95171 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCELO95171 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCELO95171 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCELO95171 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCELO95171 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCELO95171 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCELO95171 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCELO95171 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCELO95171 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCELO95171 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCELO95171 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCELO95171 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCELO95171 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCELO95171 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCELO95171 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCELO95171 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCELO95171 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCELO95171 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCELO95171 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCELO95171 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCELO95171 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCELO95171 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCELO95171 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCELO95171 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCELO95171 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCELO95171 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCELO95171 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCELO95171 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCELO95171 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCELO95171 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCELO95171 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCELO95171 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCELO95171 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCELO95171 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCELO95171 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCELO95171 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCELO95171 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCELO95171 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCELO95171 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCELO95171 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCELO95171 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCELO95171 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCELO95171 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCELO95171 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCELO95171 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCELO95171 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCELO95171 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCELO95171 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCELO95171 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCELO95171 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCELO95171 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCELO95171 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCELO95171 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCELO95171 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCELO95171 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCELO95171 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCELO95171 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCELO95171 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCELO95171 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCELO95171 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCELO95171 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCELO95171 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCELO95171 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCELO95171 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCELO95171 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCELO95171 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCELO95171 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms