Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCELO95171 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCELO95171 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
SCELO95171 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SCELO95171 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SCELO95171 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SCELO95171 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCELO95171 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCELO95171 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCELO95171 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCELO95171 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCELO95171 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCELO95171 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCELO95171 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCELO95171 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCELO95171 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCELO95171 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCELO95171 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCELO95171 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCELO95171 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCELO95171 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
SCELO95171 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCELO95171 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCELO95171 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCELO95171 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCELO95171 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCELO95171 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCELO95171 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCELO95171 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCELO95171 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCELO95171 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCELO95171 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCELO95171 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCELO95171 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCELO95171 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCELO95171 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCELO95171 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCELO95171 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCELO95171 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCELO95171 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCELO95171 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCELO95171 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCELO95171 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCELO95171 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCELO95171 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCELO95171 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCELO95171 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCELO95171 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCELO95171 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCELO95171 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCELO95171 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCELO95171 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCELO95171 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCELO95171 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCELO95171 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCELO95171 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCELO95171 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCELO95171 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCELO95171 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCELO95171 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCELO95171 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCELO95171 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCELO95171 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCELO95171 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCELO95171 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCELO95171 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCELO95171 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SCELO95171 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCELO95171 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCELO95171 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCELO95171 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCELO95171 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCELO95171 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCELO95171 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCELO95171 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCELO95171 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCELO95171 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCELO95171 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCELO95171 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCELO95171 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCELO95171 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCELO95171 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCELO95171 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCELO95171 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCELO95171 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCELO95171 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCELO95171 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCELO95171 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCELO95171 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCELO95171 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCELO95171 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCELO95171 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCELO95171 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCELO95171 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCELO95171 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCELO95171 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCELO95171 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCELO95171 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCELO95171 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCELO95171 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms