Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLSTN1O94985 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLSTN1O94985 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLSTN1O94985 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLSTN1O94985 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLSTN1O94985 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLSTN1O94985 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CLSTN1O94985 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLSTN1O94985 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLSTN1O94985 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLSTN1O94985 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLSTN1O94985 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLSTN1O94985 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLSTN1O94985 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLSTN1O94985 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLSTN1O94985 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLSTN1O94985 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLSTN1O94985 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLSTN1O94985 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLSTN1O94985 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLSTN1O94985 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLSTN1O94985 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLSTN1O94985 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLSTN1O94985 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLSTN1O94985 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLSTN1O94985 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLSTN1O94985 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLSTN1O94985 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLSTN1O94985 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLSTN1O94985 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLSTN1O94985 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLSTN1O94985 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLSTN1O94985 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLSTN1O94985 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLSTN1O94985 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLSTN1O94985 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLSTN1O94985 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLSTN1O94985 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSTN1O94985 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSTN1O94985 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSTN1O94985 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSTN1O94985 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLSTN1O94985 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLSTN1O94985 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLSTN1O94985 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLSTN1O94985 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSTN1O94985 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSTN1O94985 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSTN1O94985 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSTN1O94985 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSTN1O94985 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSTN1O94985 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSTN1O94985 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSTN1O94985 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLSTN1O94985 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSTN1O94985 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLSTN1O94985 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CLSTN1O94985 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLSTN1O94985 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLSTN1O94985 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLSTN1O94985 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSTN1O94985 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSTN1O94985 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSTN1O94985 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSTN1O94985 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSTN1O94985 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSTN1O94985 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSTN1O94985 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLSTN1O94985 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLSTN1O94985 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSTN1O94985 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLSTN1O94985 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLSTN1O94985 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSTN1O94985 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSTN1O94985 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSTN1O94985 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLSTN1O94985 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLSTN1O94985 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLSTN1O94985 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLSTN1O94985 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLSTN1O94985 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLSTN1O94985 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLSTN1O94985 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLSTN1O94985 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CLSTN1O94985 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLSTN1O94985 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLSTN1O94985 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms