Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PHACTR2O75167 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHACTR2O75167 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PHACTR2O75167 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHACTR2O75167 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHACTR2O75167 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHACTR2O75167 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHACTR2O75167 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHACTR2O75167 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHACTR2O75167 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PHACTR2O75167 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PHACTR2O75167 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHACTR2O75167 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHACTR2O75167 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHACTR2O75167 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHACTR2O75167 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PHACTR2O75167 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHACTR2O75167 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHACTR2O75167 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHACTR2O75167 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHACTR2O75167 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHACTR2O75167 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PHACTR2O75167 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PHACTR2O75167 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PHACTR2O75167 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PHACTR2O75167 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHACTR2O75167 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHACTR2O75167 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHACTR2O75167 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHACTR2O75167 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHACTR2O75167 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHACTR2O75167 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHACTR2O75167 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHACTR2O75167 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHACTR2O75167 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHACTR2O75167 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHACTR2O75167 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHACTR2O75167 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHACTR2O75167 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHACTR2O75167 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHACTR2O75167 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHACTR2O75167 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PHACTR2O75167 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHACTR2O75167 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHACTR2O75167 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHACTR2O75167 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PHACTR2O75167 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHACTR2O75167 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHACTR2O75167 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PHACTR2O75167 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PHACTR2O75167 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PHACTR2O75167 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PHACTR2O75167 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PHACTR2O75167 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHACTR2O75167 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PHACTR2O75167 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHACTR2O75167 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHACTR2O75167 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PHACTR2O75167 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PHACTR2O75167 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PHACTR2O75167 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHACTR2O75167 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHACTR2O75167 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHACTR2O75167 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHACTR2O75167 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PHACTR2O75167 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHACTR2O75167 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHACTR2O75167 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHACTR2O75167 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PHACTR2O75167 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHACTR2O75167 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHACTR2O75167 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHACTR2O75167 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHACTR2O75167 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHACTR2O75167 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHACTR2O75167 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHACTR2O75167 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHACTR2O75167 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHACTR2O75167 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHACTR2O75167 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHACTR2O75167 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHACTR2O75167 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PHACTR2O75167 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHACTR2O75167 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHACTR2O75167 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHACTR2O75167 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHACTR2O75167 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PHACTR2O75167 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHACTR2O75167 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR2O75167 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR2O75167 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHACTR2O75167 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PHACTR2O75167 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHACTR2O75167 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHACTR2O75167 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHACTR2O75167 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHACTR2O75167 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHACTR2O75167 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHACTR2O75167 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHACTR2O75167 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms