Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNGR3O43761 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNGR3O43761 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNGR3O43761 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGR3O43761 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGR3O43761 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNGR3O43761 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGR3O43761 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGR3O43761 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGR3O43761 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGR3O43761 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGR3O43761 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGR3O43761 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGR3O43761 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGR3O43761 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGR3O43761 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGR3O43761 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNGR3O43761 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNGR3O43761 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNGR3O43761 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNGR3O43761 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGR3O43761 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGR3O43761 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNGR3O43761 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNGR3O43761 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNGR3O43761 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNGR3O43761 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGR3O43761 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGR3O43761 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGR3O43761 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNGR3O43761 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGR3O43761 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGR3O43761 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGR3O43761 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGR3O43761 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNGR3O43761 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGR3O43761 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGR3O43761 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGR3O43761 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGR3O43761 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGR3O43761 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGR3O43761 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGR3O43761 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGR3O43761 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGR3O43761 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGR3O43761 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGR3O43761 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGR3O43761 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGR3O43761 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGR3O43761 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGR3O43761 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGR3O43761 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGR3O43761 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGR3O43761 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNGR3O43761 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGR3O43761 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGR3O43761 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGR3O43761 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGR3O43761 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGR3O43761 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGR3O43761 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGR3O43761 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGR3O43761 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGR3O43761 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGR3O43761 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGR3O43761 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGR3O43761 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNGR3O43761 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNGR3O43761 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGR3O43761 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGR3O43761 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGR3O43761 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGR3O43761 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGR3O43761 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGR3O43761 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGR3O43761 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGR3O43761 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGR3O43761 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNGR3O43761 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNGR3O43761 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNGR3O43761 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNGR3O43761 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNGR3O43761 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNGR3O43761 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms