Protein–RNA interactions for Protein: O43678

NDUFA2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA2O43678 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA2O43678 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA2O43678 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFA2O43678 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFA2O43678 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFA2O43678 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFA2O43678 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFA2O43678 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFA2O43678 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFA2O43678 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFA2O43678 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFA2O43678 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFA2O43678 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFA2O43678 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFA2O43678 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA2O43678 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA2O43678 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFA2O43678 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFA2O43678 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFA2O43678 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFA2O43678 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFA2O43678 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFA2O43678 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFA2O43678 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFA2O43678 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFA2O43678 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFA2O43678 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFA2O43678 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFA2O43678 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA2O43678 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA2O43678 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA2O43678 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFA2O43678 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFA2O43678 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA2O43678 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFA2O43678 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFA2O43678 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFA2O43678 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFA2O43678 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDUFA2O43678 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA2O43678 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA2O43678 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA2O43678 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA2O43678 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA2O43678 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFA2O43678 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA2O43678 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA2O43678 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA2O43678 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA2O43678 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFA2O43678 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFA2O43678 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFA2O43678 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFA2O43678 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFA2O43678 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFA2O43678 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA2O43678 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA2O43678 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA2O43678 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA2O43678 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA2O43678 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA2O43678 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA2O43678 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA2O43678 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFA2O43678 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA2O43678 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA2O43678 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA2O43678 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFA2O43678 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFA2O43678 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA2O43678 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFA2O43678 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFA2O43678 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFA2O43678 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFA2O43678 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFA2O43678 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFA2O43678 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFA2O43678 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA2O43678 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA2O43678 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFA2O43678 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFA2O43678 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFA2O43678 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA2O43678 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA2O43678 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA2O43678 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms