Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF208O43345 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF208O43345 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF208O43345 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF208O43345 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF208O43345 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF208O43345 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF208O43345 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF208O43345 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF208O43345 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF208O43345 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF208O43345 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF208O43345 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF208O43345 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF208O43345 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF208O43345 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF208O43345 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF208O43345 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF208O43345 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF208O43345 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF208O43345 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF208O43345 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF208O43345 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF208O43345 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF208O43345 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF208O43345 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF208O43345 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF208O43345 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF208O43345 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF208O43345 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF208O43345 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF208O43345 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF208O43345 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF208O43345 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF208O43345 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF208O43345 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF208O43345 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF208O43345 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF208O43345 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF208O43345 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF208O43345 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF208O43345 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF208O43345 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF208O43345 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF208O43345 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF208O43345 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF208O43345 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF208O43345 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF208O43345 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF208O43345 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF208O43345 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF208O43345 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF208O43345 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF208O43345 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF208O43345 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF208O43345 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF208O43345 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF208O43345 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF208O43345 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF208O43345 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF208O43345 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF208O43345 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF208O43345 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF208O43345 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF208O43345 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF208O43345 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF208O43345 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF208O43345 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF208O43345 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF208O43345 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF208O43345 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms