Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCL22O00626 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCL22O00626 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCL22O00626 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCL22O00626 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCL22O00626 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCL22O00626 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCL22O00626 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCL22O00626 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCL22O00626 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCL22O00626 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCL22O00626 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCL22O00626 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCL22O00626 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCL22O00626 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCL22O00626 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCL22O00626 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCL22O00626 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCL22O00626 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCL22O00626 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCL22O00626 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCL22O00626 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCL22O00626 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCL22O00626 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCL22O00626 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCL22O00626 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCL22O00626 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCL22O00626 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCL22O00626 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCL22O00626 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCL22O00626 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCL22O00626 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCL22O00626 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCL22O00626 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCL22O00626 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCL22O00626 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCL22O00626 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCL22O00626 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL22O00626 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL22O00626 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL22O00626 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCL22O00626 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCL22O00626 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCL22O00626 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCL22O00626 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCL22O00626 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCL22O00626 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCL22O00626 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCL22O00626 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCL22O00626 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCL22O00626 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCL22O00626 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCL22O00626 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCL22O00626 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCL22O00626 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCL22O00626 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCL22O00626 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCL22O00626 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCL22O00626 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCL22O00626 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCL22O00626 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCL22O00626 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCL22O00626 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCL22O00626 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCL22O00626 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCL22O00626 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCL22O00626 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCL22O00626 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCL22O00626 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCL22O00626 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCL22O00626 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCL22O00626 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCL22O00626 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCL22O00626 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCL22O00626 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL22O00626 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCL22O00626 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCL22O00626 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCL22O00626 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCL22O00626 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCL22O00626 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCL22O00626 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCL22O00626 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCL22O00626 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCL22O00626 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCL22O00626 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCL22O00626 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCL22O00626 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCL22O00626 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCL22O00626 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCL22O00626 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCL22O00626 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCL22O00626 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCL22O00626 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCL22O00626 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCL22O00626 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCL22O00626 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCL22O00626 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCL22O00626 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCL22O00626 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms