Protein–RNA interactions for Protein: A2RRL7

TMEM213, Transmembrane protein 213, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM213A2RRL7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM213A2RRL7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM213A2RRL7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM213A2RRL7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM213A2RRL7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM213A2RRL7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM213A2RRL7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM213A2RRL7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM213A2RRL7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM213A2RRL7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM213A2RRL7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM213A2RRL7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM213A2RRL7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM213A2RRL7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM213A2RRL7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM213A2RRL7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM213A2RRL7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM213A2RRL7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM213A2RRL7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM213A2RRL7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM213A2RRL7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM213A2RRL7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM213A2RRL7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM213A2RRL7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM213A2RRL7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM213A2RRL7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM213A2RRL7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM213A2RRL7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM213A2RRL7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM213A2RRL7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM213A2RRL7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM213A2RRL7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM213A2RRL7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM213A2RRL7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM213A2RRL7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM213A2RRL7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM213A2RRL7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM213A2RRL7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM213A2RRL7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM213A2RRL7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM213A2RRL7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM213A2RRL7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM213A2RRL7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM213A2RRL7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM213A2RRL7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM213A2RRL7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM213A2RRL7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM213A2RRL7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM213A2RRL7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM213A2RRL7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM213A2RRL7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM213A2RRL7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM213A2RRL7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM213A2RRL7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM213A2RRL7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM213A2RRL7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM213A2RRL7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM213A2RRL7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM213A2RRL7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM213A2RRL7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM213A2RRL7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM213A2RRL7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM213A2RRL7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM213A2RRL7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM213A2RRL7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM213A2RRL7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms