Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GX30

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GX30 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GX30 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GX30 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GX30 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1B0GX30 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GX30 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GX30 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GX30 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GX30 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GX30 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GX30 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GX30 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GX30 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GX30 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GX30 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GX30 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GX30 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GX30 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GX30 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GX30 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GX30 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GX30 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GX30 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GX30 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GX30 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GX30 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GX30 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GX30 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GX30 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GX30 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GX30 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GX30 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GX30 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1B0GX30 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1B0GX30 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1B0GX30 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1B0GX30 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1B0GX30 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1B0GX30 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1B0GX30 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1B0GX30 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1B0GX30 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1B0GX30 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1B0GX30 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1B0GX30 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1B0GX30 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GX30 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GX30 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GX30 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GX30 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GX30 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GX30 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GX30 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GX30 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GX30 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GX30 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GX30 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GX30 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GX30 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GX30 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GX30 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GX30 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GX30 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GX30 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GX30 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GX30 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GX30 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GX30 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GX30 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms