Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1U6

TRBV9, T-cell receptor beta variable 9 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV9A0A0B4J1U6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV9A0A0B4J1U6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV9A0A0B4J1U6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV9A0A0B4J1U6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV9A0A0B4J1U6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV9A0A0B4J1U6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV9A0A0B4J1U6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV9A0A0B4J1U6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV9A0A0B4J1U6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV9A0A0B4J1U6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV9A0A0B4J1U6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV9A0A0B4J1U6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV9A0A0B4J1U6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV9A0A0B4J1U6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV9A0A0B4J1U6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBV9A0A0B4J1U6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV9A0A0B4J1U6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV9A0A0B4J1U6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV9A0A0B4J1U6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV9A0A0B4J1U6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV9A0A0B4J1U6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV9A0A0B4J1U6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV9A0A0B4J1U6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV9A0A0B4J1U6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRBV9A0A0B4J1U6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV9A0A0B4J1U6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV9A0A0B4J1U6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV9A0A0B4J1U6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV9A0A0B4J1U6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV9A0A0B4J1U6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV9A0A0B4J1U6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV9A0A0B4J1U6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV9A0A0B4J1U6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV9A0A0B4J1U6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV9A0A0B4J1U6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV9A0A0B4J1U6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV9A0A0B4J1U6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV9A0A0B4J1U6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV9A0A0B4J1U6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV9A0A0B4J1U6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV9A0A0B4J1U6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV9A0A0B4J1U6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV9A0A0B4J1U6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV9A0A0B4J1U6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV9A0A0B4J1U6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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