Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS01

TRGV10, T-cell receptor gamma variable 10 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGV10A0A0A0MS01 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRGV10A0A0A0MS01 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRGV10A0A0A0MS01 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRGV10A0A0A0MS01 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRGV10A0A0A0MS01 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRGV10A0A0A0MS01 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRGV10A0A0A0MS01 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRGV10A0A0A0MS01 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRGV10A0A0A0MS01 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRGV10A0A0A0MS01 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRGV10A0A0A0MS01 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRGV10A0A0A0MS01 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRGV10A0A0A0MS01 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRGV10A0A0A0MS01 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRGV10A0A0A0MS01 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRGV10A0A0A0MS01 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRGV10A0A0A0MS01 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRGV10A0A0A0MS01 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRGV10A0A0A0MS01 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRGV10A0A0A0MS01 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRGV10A0A0A0MS01 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRGV10A0A0A0MS01 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRGV10A0A0A0MS01 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRGV10A0A0A0MS01 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRGV10A0A0A0MS01 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRGV10A0A0A0MS01 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRGV10A0A0A0MS01 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRGV10A0A0A0MS01 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRGV10A0A0A0MS01 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRGV10A0A0A0MS01 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRGV10A0A0A0MS01 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRGV10A0A0A0MS01 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRGV10A0A0A0MS01 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRGV10A0A0A0MS01 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRGV10A0A0A0MS01 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRGV10A0A0A0MS01 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRGV10A0A0A0MS01 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRGV10A0A0A0MS01 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRGV10A0A0A0MS01 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRGV10A0A0A0MS01 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRGV10A0A0A0MS01 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRGV10A0A0A0MS01 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRGV10A0A0A0MS01 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRGV10A0A0A0MS01 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRGV10A0A0A0MS01 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRGV10A0A0A0MS01 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRGV10A0A0A0MS01 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRGV10A0A0A0MS01 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRGV10A0A0A0MS01 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRGV10A0A0A0MS01 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRGV10A0A0A0MS01 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRGV10A0A0A0MS01 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRGV10A0A0A0MS01 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRGV10A0A0A0MS01 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRGV10A0A0A0MS01 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRGV10A0A0A0MS01 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRGV10A0A0A0MS01 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRGV10A0A0A0MS01 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRGV10A0A0A0MS01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRGV10A0A0A0MS01 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRGV10A0A0A0MS01 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRGV10A0A0A0MS01 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRGV10A0A0A0MS01 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRGV10A0A0A0MS01 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRGV10A0A0A0MS01 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRGV10A0A0A0MS01 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRGV10A0A0A0MS01 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRGV10A0A0A0MS01 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRGV10A0A0A0MS01 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRGV10A0A0A0MS01 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRGV10A0A0A0MS01 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRGV10A0A0A0MS01 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRGV10A0A0A0MS01 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRGV10A0A0A0MS01 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRGV10A0A0A0MS01 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRGV10A0A0A0MS01 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRGV10A0A0A0MS01 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRGV10A0A0A0MS01 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRGV10A0A0A0MS01 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRGV10A0A0A0MS01 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRGV10A0A0A0MS01 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRGV10A0A0A0MS01 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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