Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP4P49662 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP4P49662 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms