RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297195.8

SLC29A4-201, Transcript of solute carrier family 29 member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC29A4, Length 2,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4-201ENST00000297195 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.47■■■□□ 2.47
SLC29A4-201ENST00000297195 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC29A4-201ENST00000297195 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SLC29A4-201ENST00000297195 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.25■■□□□ 1.63
SLC29A4-201ENST00000297195 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC29A4-201ENST00000297195 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC29A4-201ENST00000297195 ABCC9O60706 1549 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC29A4-201ENST00000297195 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.76■■□□□ 1.55
SLC29A4-201ENST00000297195 NACADO15069 1562 aa24.64■■□□□ 1.53
SLC29A4-201ENST00000297195 SCRIBQ14160 1630 aa24.5■■□□□ 1.51
SLC29A4-201ENST00000297195 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
SLC29A4-201ENST00000297195 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.44■■□□□ 1.5
SLC29A4-201ENST00000297195 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC29A4-201ENST00000297195 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.74■■□□□ 1.39
SLC29A4-201ENST00000297195 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC29A4-201ENST00000297195 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SLC29A4-201ENST00000297195 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.383e-7■□□□□ 9.8
SLC29A4-201ENST00000297195 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.63■■□□□ 1.37
SLC29A4-201ENST00000297195 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC29A4-201ENST00000297195 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SLC29A4-201ENST00000297195 WIZO95785 1651 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC29A4-201ENST00000297195 SMARCA4P51532 1647 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC29A4-201ENST00000297195 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SLC29A4-201ENST00000297195 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC29A4-201ENST00000297195 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SLC29A4-201ENST00000297195 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.99■■□□□ 1.27
SLC29A4-201ENST00000297195 SMARCA2P51531 1590 aa22.97■■□□□ 1.27
SLC29A4-201ENST00000297195 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.95■■□□□ 1.26
SLC29A4-201ENST00000297195 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.91■■□□□ 1.26
SLC29A4-201ENST00000297195 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SLC29A4-201ENST00000297195 TRIM41Q8WV44 630 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC29A4-201ENST00000297195 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.75■■□□□ 1.23
SLC29A4-201ENST00000297195 HMGXB3Q12766 1538 aa22.74■■□□□ 1.23
SLC29A4-201ENST00000297195 NCAPD3P42695 1498 aa22.74■■□□□ 1.23
SLC29A4-201ENST00000297195 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC29A4-201ENST00000297195 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SLC29A4-201ENST00000297195 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.58■■□□□ 1.2
SLC29A4-201ENST00000297195 HRCP23327 699 aa22.56■■□□□ 1.2
SLC29A4-201ENST00000297195 ABCC8Q09428 1581 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC29A4-201ENST00000297195 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC29A4-201ENST00000297195 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SLC29A4-201ENST00000297195 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SLC29A4-201ENST00000297195 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4-201ENST00000297195 CFTRP13569 1480 aa22.29■■□□□ 1.16
SLC29A4-201ENST00000297195 SYNJ1O43426 1573 aa22.26■■□□□ 1.15
SLC29A4-201ENST00000297195 PRDM2Q13029 1718 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC29A4-201ENST00000297195 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC29A4-201ENST00000297195 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SLC29A4-201ENST00000297195 TOP2BQ02880 1626 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC29A4-201ENST00000297195 SOGA1O94964 1423 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC29A4-201ENST00000297195 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC29A4-201ENST00000297195 NESP48681 1621 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC29A4-201ENST00000297195 CUX1P39880 1505 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC29A4-201ENST00000297195 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC29A4-201ENST00000297195 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC29A4-201ENST00000297195 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC29A4-201ENST00000297195 EEA1Q15075 1411 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC29A4-201ENST00000297195 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC29A4-201ENST00000297195 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC29A4-201ENST00000297195 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC29A4-201ENST00000297195 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC29A4-201ENST00000297195 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC29A4-201ENST00000297195 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC29A4-201ENST00000297195 MYT1Q01538 1121 aa21.76■■□□□ 1.07
SLC29A4-201ENST00000297195 TOPBP1Q92547 1522 aa21.75■■□□□ 1.07
SLC29A4-201ENST00000297195 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SLC29A4-201ENST00000297195 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SLC29A4-201ENST00000297195 KIF21BO75037 1637 aa21.74■■□□□ 1.07
SLC29A4-201ENST00000297195 GOLGA3Q08378 1498 aa21.73■■□□□ 1.07
SLC29A4-201ENST00000297195 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SLC29A4-201ENST00000297195 CEP162Q5TB80 1403 aa21.71■■□□□ 1.07
SLC29A4-201ENST00000297195 KIF27Q86VH2 1401 aa21.71■■□□□ 1.07
SLC29A4-201ENST00000297195 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SLC29A4-201ENST00000297195 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.68■■□□□ 1.06
SLC29A4-201ENST00000297195 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SLC29A4-201ENST00000297195 CUX2O14529 1486 aa21.67■■□□□ 1.06
SLC29A4-201ENST00000297195 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.64■■□□□ 1.06
SLC29A4-201ENST00000297195 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.62■■□□□ 1.05
SLC29A4-201ENST00000297195 PRXQ9BXM0 1461 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC29A4-201ENST00000297195 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC29A4-201ENST00000297195 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC29A4-201ENST00000297195 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC29A4-201ENST00000297195 WDR97A6NE52 1622 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC29A4-201ENST00000297195 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4-201ENST00000297195 IGF1RP08069 1367 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC29A4-201ENST00000297195 ERCC6Q03468 1493 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC29A4-201ENST00000297195 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SLC29A4-201ENST00000297195 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SLC29A4-201ENST00000297195 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SLC29A4-201ENST00000297195 WDR62O43379 1518 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC29A4-201ENST00000297195 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC29A4-201ENST00000297195 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SLC29A4-201ENST00000297195 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC29A4-201ENST00000297195 CLIP1P30622 1438 aa21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4-201ENST00000297195 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SLC29A4-201ENST00000297195 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SLC29A4-201ENST00000297195 CUL7Q14999 1698 aa21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4-201ENST00000297195 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.35■■□□□ 1.01
SLC29A4-201ENST00000297195 PBRM1Q86U86 1689 aa21.27■■□□□ 1
SLC29A4-201ENST00000297195 IFT140Q96RY7 1462 aa21.26■□□□□ 0.99
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