Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms