RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.25■■■□□ 2.75
NICN1-201ENST00000273598 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.88■■■□□ 2.05
NICN1-201ENST00000273598 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
NICN1-201ENST00000273598 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.96■■□□□ 1.91
NICN1-201ENST00000273598 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.77■■□□□ 1.88
NICN1-201ENST00000273598 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.54■■□□□ 1.84
NICN1-201ENST00000273598 ABCC9O60706 1549 aa26.43■■□□□ 1.82
NICN1-201ENST00000273598 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.11■■□□□ 1.77
NICN1-201ENST00000273598 NACADO15069 1562 aa25.98■■□□□ 1.75
NICN1-201ENST00000273598 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
NICN1-201ENST00000273598 SCRIBQ14160 1630 aa25.87■■□□□ 1.73
NICN1-201ENST00000273598 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.74■■□□□ 1.71
NICN1-201ENST00000273598 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.18■■□□□ 1.62
NICN1-201ENST00000273598 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NICN1-201ENST00000273598 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.13■■□□□ 1.61
NICN1-201ENST00000273598 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
NICN1-201ENST00000273598 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.98■■□□□ 1.59
NICN1-201ENST00000273598 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.93■■□□□ 1.58
NICN1-201ENST00000273598 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
NICN1-201ENST00000273598 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.81■■□□□ 1.56
NICN1-201ENST00000273598 WIZO95785 1651 aa24.79■■□□□ 1.56
NICN1-201ENST00000273598 SMARCA4P51532 1647 aa24.73■■□□□ 1.55
NICN1-201ENST00000273598 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
NICN1-201ENST00000273598 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.32■■□□□ 1.48
NICN1-201ENST00000273598 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.31■■□□□ 1.48
NICN1-201ENST00000273598 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.3■■□□□ 1.48
NICN1-201ENST00000273598 TRIM41Q8WV44 630 aa24.29■■□□□ 1.48
NICN1-201ENST00000273598 SMARCA2P51531 1590 aa24.26■■□□□ 1.47
NICN1-201ENST00000273598 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
NICN1-201ENST00000273598 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
NICN1-201ENST00000273598 NCAPD3P42695 1498 aa24.01■■□□□ 1.43
NICN1-201ENST00000273598 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.98■■□□□ 1.43
NICN1-201ENST00000273598 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
NICN1-201ENST00000273598 HMGXB3Q12766 1538 aa23.95■■□□□ 1.42
NICN1-201ENST00000273598 ABCC8Q09428 1581 aa23.91■■□□□ 1.42
NICN1-201ENST00000273598 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.81■■□□□ 1.4
NICN1-201ENST00000273598 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.72■■□□□ 1.39
NICN1-201ENST00000273598 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
NICN1-201ENST00000273598 CFTRP13569 1480 aa23.57■■□□□ 1.36
NICN1-201ENST00000273598 SYNJ1O43426 1573 aa23.55■■□□□ 1.36
NICN1-201ENST00000273598 SOGA1O94964 1423 aa23.54■■□□□ 1.36
NICN1-201ENST00000273598 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.49■■□□□ 1.35
NICN1-201ENST00000273598 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.44■■□□□ 1.34
NICN1-201ENST00000273598 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.43■■□□□ 1.34
NICN1-201ENST00000273598 EEA1Q15075 1411 aa23.42■■□□□ 1.34
NICN1-201ENST00000273598 TOP2BQ02880 1626 aa23.4■■□□□ 1.34
NICN1-201ENST00000273598 PRDM2Q13029 1718 aa23.33■■□□□ 1.33
NICN1-201ENST00000273598 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.32■■□□□ 1.32
NICN1-201ENST00000273598 CUX1P39880 1505 aa23.32■■□□□ 1.32
NICN1-201ENST00000273598 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.3■■□□□ 1.32
NICN1-201ENST00000273598 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
NICN1-201ENST00000273598 NESP48681 1621 aa23.25■■□□□ 1.31
NICN1-201ENST00000273598 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.23■■□□□ 1.31
NICN1-201ENST00000273598 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.17■■□□□ 1.3
NICN1-201ENST00000273598 GOLGA3Q08378 1498 aa23.17■■□□□ 1.3
NICN1-201ENST00000273598 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.15■■□□□ 1.3
NICN1-201ENST00000273598 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.14■■□□□ 1.29
NICN1-201ENST00000273598 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.14■■□□□ 1.29
NICN1-201ENST00000273598 KIF27Q86VH2 1401 aa23.09■■□□□ 1.29
NICN1-201ENST00000273598 CEP162Q5TB80 1403 aa23.08■■□□□ 1.28
NICN1-201ENST00000273598 KIF21BO75037 1637 aa23.07■■□□□ 1.28
NICN1-201ENST00000273598 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.06■■□□□ 1.28
NICN1-201ENST00000273598 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.05■■□□□ 1.28
NICN1-201ENST00000273598 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.02■■□□□ 1.28
NICN1-201ENST00000273598 CUX2O14529 1486 aa23■■□□□ 1.27
NICN1-201ENST00000273598 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NICN1-201ENST00000273598 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.99■■□□□ 1.27
NICN1-201ENST00000273598 TOPBP1Q92547 1522 aa22.98■■□□□ 1.27
NICN1-201ENST00000273598 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
NICN1-201ENST00000273598 PRXQ9BXM0 1461 aa22.93■■□□□ 1.26
NICN1-201ENST00000273598 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NICN1-201ENST00000273598 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
NICN1-201ENST00000273598 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NICN1-201ENST00000273598 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.89■■□□□ 1.26
NICN1-201ENST00000273598 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.88■■□□□ 1.25
NICN1-201ENST00000273598 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.87■■□□□ 1.25
NICN1-201ENST00000273598 IGF1RP08069 1367 aa22.87■■□□□ 1.25
NICN1-201ENST00000273598 CLIP1P30622 1438 aa22.86■■□□□ 1.25
NICN1-201ENST00000273598 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.8■■□□□ 1.24
NICN1-201ENST00000273598 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.79■■□□□ 1.24
NICN1-201ENST00000273598 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NICN1-201ENST00000273598 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
NICN1-201ENST00000273598 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.69■■□□□ 1.22
NICN1-201ENST00000273598 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.65■■□□□ 1.22
NICN1-201ENST00000273598 ERCC6Q03468 1493 aa22.64■■□□□ 1.22
NICN1-201ENST00000273598 APLP2Q06481 763 aa22.62■■□□□ 1.21
NICN1-201ENST00000273598 WDR97A6NE52 1622 aa22.61■■□□□ 1.21
NICN1-201ENST00000273598 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.61■■□□□ 1.21
NICN1-201ENST00000273598 HRCP23327 699 aa22.59■■□□□ 1.21
NICN1-201ENST00000273598 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NICN1-201ENST00000273598 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.55■■□□□ 1.2
NICN1-201ENST00000273598 CUL7Q14999 1698 aa22.55■■□□□ 1.2
NICN1-201ENST00000273598 ARAP1Q96P48 1450 aa22.53■■□□□ 1.2
NICN1-201ENST00000273598 WDR62O43379 1518 aa22.51■■□□□ 1.19
NICN1-201ENST00000273598 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.5■■□□□ 1.19
NICN1-201ENST00000273598 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.193e-7■■■□□ 17
NICN1-201ENST00000273598 IFT140Q96RY7 1462 aa22.45■■□□□ 1.19
NICN1-201ENST00000273598 P3H3Q8IVL6 736 aa22.43■■□□□ 1.18
NICN1-201ENST00000273598 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
NICN1-201ENST00000273598 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
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