RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403268.1

DUSP18-204, Transcript of dual specificity phosphatase 18, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP18, Length 2,920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18-204ENST00000403268 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.47■■■□□ 2.47
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DUSP18-204ENST00000403268 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.87■■□□□ 1.73
DUSP18-204ENST00000403268 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
DUSP18-204ENST00000403268 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
DUSP18-204ENST00000403268 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.32■■□□□ 1.64
DUSP18-204ENST00000403268 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.95■■□□□ 1.58
DUSP18-204ENST00000403268 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.71■■□□□ 1.55
DUSP18-204ENST00000403268 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.65■■□□□ 1.54
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DUSP18-204ENST00000403268 ABCC9O60706 1549 aa24.29■■□□□ 1.48
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DUSP18-204ENST00000403268 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.02■■□□□ 1.44
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DUSP18-204ENST00000403268 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.88■■□□□ 1.41
DUSP18-204ENST00000403268 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.86■■□□□ 1.41
DUSP18-204ENST00000403268 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.83■■□□□ 1.41
DUSP18-204ENST00000403268 HRCP23327 699 aa23.82■■□□□ 1.4
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DUSP18-204ENST00000403268 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.68■■□□□ 1.38
DUSP18-204ENST00000403268 TRIM41Q8WV44 630 aa23.67■■□□□ 1.38
DUSP18-204ENST00000403268 WIZO95785 1651 aa23.58■■□□□ 1.37
DUSP18-204ENST00000403268 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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DUSP18-204ENST00000403268 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
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DUSP18-204ENST00000403268 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.27■■□□□ 1.32
DUSP18-204ENST00000403268 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
DUSP18-204ENST00000403268 SMARCA4P51532 1647 aa23.21■■□□□ 1.31
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DUSP18-204ENST00000403268 SMARCA2P51531 1590 aa23.07■■□□□ 1.28
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DUSP18-204ENST00000403268 BICRAQ9NZM4 1560 aa23■■□□□ 1.27
DUSP18-204ENST00000403268 SOGA1O94964 1423 aa22.83■■□□□ 1.25
DUSP18-204ENST00000403268 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
DUSP18-204ENST00000403268 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
DUSP18-204ENST00000403268 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.74■■□□□ 1.23
DUSP18-204ENST00000403268 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.74■■□□□ 1.23
DUSP18-204ENST00000403268 CEP162Q5TB80 1403 aa22.66■■□□□ 1.22
DUSP18-204ENST00000403268 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.65■■□□□ 1.22
DUSP18-204ENST00000403268 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.65■■□□□ 1.22
DUSP18-204ENST00000403268 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
DUSP18-204ENST00000403268 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.61■■□□□ 1.21
DUSP18-204ENST00000403268 EEA1Q15075 1411 aa22.6■■□□□ 1.21
DUSP18-204ENST00000403268 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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DUSP18-204ENST00000403268 SYNJ1O43426 1573 aa22.55■■□□□ 1.2
DUSP18-204ENST00000403268 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
DUSP18-204ENST00000403268 GOLGA3Q08378 1498 aa22.48■■□□□ 1.19
DUSP18-204ENST00000403268 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
DUSP18-204ENST00000403268 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
DUSP18-204ENST00000403268 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.36■■□□□ 1.17
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DUSP18-204ENST00000403268 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.26■■□□□ 1.15
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DUSP18-204ENST00000403268 NCAPD3P42695 1498 aa22.19■■□□□ 1.14
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DUSP18-204ENST00000403268 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.15■■□□□ 1.14
DUSP18-204ENST00000403268 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.13■■□□□ 1.13
DUSP18-204ENST00000403268 CUX1P39880 1505 aa22.08■■□□□ 1.12
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DUSP18-204ENST00000403268 PRXQ9BXM0 1461 aa22.02■■□□□ 1.12
DUSP18-204ENST00000403268 CFTRP13569 1480 aa22.01■■□□□ 1.11
DUSP18-204ENST00000403268 APLP2Q06481 763 aa21.99■■□□□ 1.11
DUSP18-204ENST00000403268 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.97■■□□□ 1.11
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DUSP18-204ENST00000403268 ARAP1Q96P48 1450 aa21.92■■□□□ 1.1
DUSP18-204ENST00000403268 KIF27Q86VH2 1401 aa21.91■■□□□ 1.1
DUSP18-204ENST00000403268 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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DUSP18-204ENST00000403268 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.77■■□□□ 1.08
DUSP18-204ENST00000403268 PRDM2Q13029 1718 aa21.77■■□□□ 1.08
DUSP18-204ENST00000403268 NEUROD1Q13562 356 aa21.76■■□□□ 1.07
DUSP18-204ENST00000403268 CUX2O14529 1486 aa21.75■■□□□ 1.07
DUSP18-204ENST00000403268 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.74■■□□□ 1.07
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DUSP18-204ENST00000403268 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.62■■□□□ 1.05
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DUSP18-204ENST00000403268 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
DUSP18-204ENST00000403268 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.58■■□□□ 1.04
DUSP18-204ENST00000403268 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
DUSP18-204ENST00000403268 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP18-204ENST00000403268 MIER1Q8N108 512 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP18-204ENST00000403268 ITGAEP38570 1179 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP18-204ENST00000403268 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP18-204ENST00000403268 NESP48681 1621 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP18-204ENST00000403268 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP18-204ENST00000403268 P3H3Q8IVL6 736 aa21.46■■□□□ 1.03
DUSP18-204ENST00000403268 TIAM1Q13009 1591 aa21.46■■□□□ 1.03
DUSP18-204ENST00000403268 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.44■■□□□ 1.02
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