Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM120AQ9NZB2 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 28.4
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FAM120AQ9NZB2 TMEM50A-205ENST00000491936 965 ntTSL 1 (best)15.64■□□□□ 0.099e-22■■■■■ 28.4
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FAM120AQ9NZB2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 28.4
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FAM120AQ9NZB2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 28.4
FAM120AQ9NZB2 NSMF-209ENST00000482448 551 ntTSL 311.79□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 28.4
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FAM120AQ9NZB2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 28.4
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FAM120AQ9NZB2 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)15.56■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 28.3
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FAM120AQ9NZB2 CALM3-203ENST00000477244 696 ntTSL 312.66□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 28.3
FAM120AQ9NZB2 CALM3-210ENST00000597868 927 ntTSL 311.57□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 28.3
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FAM120AQ9NZB2 IQGAP2-206ENST00000504477 2039 ntTSL 57.11□□□□□ -1.273e-14■■■■■ 28.3
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FAM120AQ9NZB2 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.438e-15■■■■■ 28.3
FAM120AQ9NZB2 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.535e-9■■■■■ 28.3
FAM120AQ9NZB2 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.723e-14■■■■■ 28.3
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FAM120AQ9NZB2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 28.2
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FAM120AQ9NZB2 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.592e-8■■■■■ 28.2
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FAM120AQ9NZB2 ABCA2-217ENST00000479446 6295 ntTSL 1 (best)20.48■□□□□ 0.878e-7■■■■■ 28.2
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FAM120AQ9NZB2 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.328e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 ABCA2-218ENST00000487109 8031 ntTSL 1 (best)12.78□□□□□ -0.368e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.388e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 ABCA2-208ENST00000459850 8073 ntTSL 1 (best)12.51□□□□□ -0.418e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 YKT6-202ENST00000421621 2463 ntTSL 1 (best)17.06■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 PQLC1-205ENST00000469369 593 ntTSL 414.8□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 PQLC1-209ENST00000589000 558 ntTSL 412.64□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.227e-11■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 320.45■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 28.2
FAM120AQ9NZB2 ARHGEF1-223ENST00000617585 737 ntTSL 224.36■■□□□ 1.496e-9■■■■■ 28.1
FAM120AQ9NZB2 ARHGEF1-217ENST00000598812 588 ntTSL 521.53■■□□□ 1.044e-8■■■■■ 28.1
FAM120AQ9NZB2 ARHGEF1-210ENST00000594521 826 ntTSL 519.02■□□□□ 0.646e-9■■■■■ 28.1
FAM120AQ9NZB2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.516e-8■■■■■ 28.1
FAM120AQ9NZB2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.364e-8■■■■■ 28.1
FAM120AQ9NZB2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.284e-8■■■■■ 28.1
FAM120AQ9NZB2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.126e-8■■■■■ 28.1
FAM120AQ9NZB2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.074e-8■■■■■ 28.1
FAM120AQ9NZB2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-8■■■■■ 28.1
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FAM120AQ9NZB2 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.134e-8■■■■■ 28.1
FAM120AQ9NZB2 ZNF384-203ENST00000361959 2978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.326e-8■■■■■ 28.1
FAM120AQ9NZB2 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.377e-10■■■■■ 28.1
FAM120AQ9NZB2 ARHGEF1-220ENST00000600274 3439 ntTSL 1 (best)11.96□□□□□ -0.494e-8■■■■■ 28.1
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